健康人与白内障患者晶状体前囊膜表观基因组分析

该数据集来自 NCBI GEO(GSE241767),针对健康人与白内障患者(ARC)的晶状体前囊膜开展表观基因组分析,使用 MethylationEPIC BeadChip(850K)检测 DNA 甲基化水平

geo
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基因组分类Methylation profiling by arrayGPL239769606
GSE241767: Epigenome analysis of anterior capsular membrane of lens in healthy and cataract patients

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-25

资源简介

健康人与白内障患者晶状体前囊膜表观基因组分析

Epigenome analysis of anterior capsular membrane of lens in healthy and cataract patients

该数据集来自 NCBI GEO(GSE241767),针对健康人与白内障患者(ARC)的晶状体前囊膜开展表观基因组分析,使用 MethylationEPIC BeadChip(850K)检测 DNA 甲基化水平。数据覆盖 ARC 组与正常对照组,共检出 52705 个差异甲基化位点,其中 13858 个高甲基化、38847 个低甲基化。该数据可用于比较两组间的甲基化模式差异,支持白内障相关表观遗传标志的探索与分类分析(来源 NCBI)。

【数据集背景】

源站首次发布:Aug 28 202。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):采用 MethylationEPIC BeadChip(850K)对 ARC 患者与正常对照的 DNA 甲基化水平进行分析。与对照组相比,ARC 组共检测到 52705 个差异甲基化位点(DMS),其中 13858 个为高甲基化,38847 个为低甲基化。

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 0 B。

【主题与分类】

主题标签:Methylation profiling by array、GPL23976、9606。本站分类:眼及附器疾病。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE241767

【使用注意】

· 源站最后修改于 Aug 27 202,引用时请注意版本时效。

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    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

采用MethylationEPIC BeadChip(850K)芯片对ARC患者和正常对照者的DNA甲基化水平进行分析。与对照组相比,ARC组共检测到52705个差异甲基化位点(DMS),其中13858个位点呈高甲基化,38847个位点呈低甲基化。本研究揭示了ARC的全基因组DNA甲基化模式和基因表达谱,并鉴定了甲基化分子标志物,可能有助于ARC的预防、诊断、治疗和预后。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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