Myodes rufocanus正常眼与晶状体混浊眼转录组测序
研究通过比较分析挖掘晶状体混浊眼相关基因与机制，聚焦先天性白内障。数据可用于差异表达分析、基因筛选及白内障机制探索（来源 NCBI）
基本信息
资源简介
Myodes rufocanus正常眼与晶状体混浊眼转录组测序
GSE231966 是一项针对 Myodes rufocanus（Sundevall, 1846）正常眼与晶状体混浊眼的转录组测序数据集，由 Shengnan、Han 提交，发布于 2024 年 5 月 8 日，来源为 NCBI。该数据集通过比较正常眼与晶状体混浊眼的转录组，挖掘与晶状体混浊相关的基因及机制，研究聚焦于先天性白内障。数据集归类于眼及附器疾病下的其他类别，包含 1 个文件，样例文件为 GSE231966_series_matrix.txt.gz，主题标签涉及高通量测序表达谱分析、GPL33394 平台及编号 2929754。整体而言，该数据可用于差异表达分析、候选基因筛选以及白内障发生机制的探索。
【数据集背景】
先天性白内障是导致视觉发育异常的重要眼病之一，其分子机制涉及多种基因与调控通路。该数据集以 Myodes rufocanus 为研究对象，选取正常眼与晶状体混浊眼组织进行转录组测序，旨在通过分析与比较挖掘晶状体混浊眼背后的基因与机制，为先天性白内障相关研究提供转录组层面的数据基础。源站描述明确指出，研究通过比较正常眼与晶状体混浊眼来挖掘相关基因与机制，并围绕先天性白内障展开调查。
【数据内容】
该数据集为转录组测序表达谱数据，主题标签包括 Expression profiling by high throughput sequencing、GPL33394 与 2929754。数据集共包含 1 个文件，样例文件名为 GSE231966_series_matrix.txt.gz，采用 GZIP 压缩格式。文件内容对应正常眼与晶状体混浊眼样本的转录组测序结果，可用于后续的表达谱分析与比较。关于样本数量、分组细节、测序深度、基因注释版本等具体信息，源站未提供。
【采集与来源】
数据来源于 ncbi.nlm.nih.gov，源站标题为“Transcriptome sequencing of normal and lens clouded eyes in the Myodes rufocanus (Sundevall, 1846)”。作者为 Shengnan、Han，发布时间为 2024 年 5 月 8 日。研究选取正常 Myodes rufocanus 眼与晶状体混浊眼进行转录组测序，并通过分析与比较挖掘晶状体混浊眼相关基因与机制。关于样本采集地点、采集时间、伦理审批及测序平台的具体运行参数，源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于差异表达分析、候选基因筛选以及白内障机制探索等研究方向。研究者可基于正常眼与晶状体混浊眼的转录组比较，识别与晶状体混浊相关的表达变化，进而为先天性白内障的基因与机制研究提供线索。此外，该数据也可作为眼及附器疾病相关转录组研究的参考数据。关于具体分析流程、统计方法及验证实验的设计，源站未提供。
【使用方法】
使用时可先下载数据文件 GSE231966_series_matrix.txt.gz，按 GZIP 压缩包格式进行读取。建议先在小样本上核对字段与编码，确认无误后再批量接入分析流程。由于数据集仅包含 1 个文件，使用时应结合文件内的样本与表达信息组织分析。关于文件内具体字段含义、注释信息及推荐分析工具，源站未提供。
【质量与限制】
该数据集仅包含 1 个文件，样本规模与分组信息在现有描述中未充分展开，使用前需自行核对文件内容与编码。关于数据质量评估、批次效应、重复样本设置及测序质量控制指标，源站未提供。研究结论的推广需结合具体实验设计与验证结果，源站未提供相关验证信息。
【引用与许可】
引用该数据集时应参考源站标题及作者信息（Shengnan、Han），并注明来源 ncbi.nlm.nih.gov。关于数据许可条款、使用限制及正式引用格式，源站未提供。
下载信息
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需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE231966
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
我们选取了正常的棕背䶄眼和晶状体混浊眼进行转录组测序，并通过分析比较对晶状体混浊眼进行了挖掘。我们研究了先天性白内障所涉及的基因和机制。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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