对照与Dnmt3a条件性敲除视网膜神经节细胞视神经夹伤后2天单核RNA-seq分析

该数据集来自小鼠视神经夹伤模型,对视网膜神经节细胞特异性Dnmt3a条件性敲除(cKO)与对照组的视网膜神经节细胞核在夹伤后2天进行单核RNA-seq分析,采用10X Genomics技术

geo
浏览 7
基因组回归GPL1905710090
GSE228627: Single nuclei RNA-seq analysis of control and Dnmt3a conditional knockout (cKO) of retinal ganglion cells at 2 days post optic nerve crush.

基本信息

模态
基因组
任务类型
回归
创建/更新时间
2026-10-10

资源简介

对照与Dnmt3a条件性敲除视网膜神经节细胞视神经夹伤后2天单核RNA-seq分析

Single nuclei RNA-seq analysis of control and Dnmt3a conditional knockout (cKO) of retinal ganglion cells at 2 days post optic nerve crush.

该数据集来自小鼠视神经夹伤模型,对视网膜神经节细胞特异性Dnmt3a条件性敲除(cKO)与对照组的视网膜神经节细胞核在夹伤后2天进行单核RNA-seq分析,采用10X Genomics技术。数据可用于研究Dnmt3a在轴突再生中的作用,比较敲除与对照条件下视网膜神经节细胞的表达谱差异,识别与再生相关的细胞亚群和基因表达变化。数据集包含1个文件,为GSE228627_series_matrix.txt.gz(来源 NCBI)。

【数据集背景】

源站首次发布:Mar 31 202。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):视网膜神经节细胞中Dnmt3a缺陷可促进视神经夹伤小鼠模型中的轴突再生。为研究Dnmt3a在轴突再生中的作用,在视神经夹伤后2天从对照组和视网膜神经节细胞特异性Dnmt3a敲除小鼠中分选视网膜神经节细胞核,并采用10X Genomics技术进行单核RNA-seq分析。

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 0 B。

【主题与分类】

主题标签:GPL19057、10090。本站分类:眼及附器疾病。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE228627

【使用注意】

· 源站最后修改于 Dec 14 202,引用时请注意版本时效。

下载信息

注册下载

需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。

暂未开放

公开下载

无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。

免登录

当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

免费样本无法满足模型训练要求?千方提供经三甲医院脱敏、带病理回证与专家标注的商业级专病数据集。

使用方式

数据集获取

源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE228627

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

视网膜神经节细胞中Dnmt3a缺陷促进视神经夹伤小鼠模型中的轴突再生。为探究Dnmt3a在轴突再生中的作用,在视神经夹伤后第2天,从对照组和视网膜神经节细胞特异性Dnmt3a敲除小鼠中分选视网膜神经节细胞核,并采用10X Genomics技术进行单核RNA测序分析。

需要用于商业化训练或医疗器械注册(NMPA/FDA)?

公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托三甲直采网络,提供合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。