人晶状体上皮细胞离体损伤应答数据集

该数据集来自 NCBI GEO(GSE186716),研究人晶状体上皮细胞对机械损伤的离体应答。样本取自眼库供研究用的老年尸体眼,通过体外连续环形撕囊模拟白内障手术损伤,分别收集撕囊中央区上皮细胞、皮质纤维细胞及赤道部上皮细胞(即刻固定或培养24小时后固定),以 RNA later 稳定后进行高通量

geo
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基因组分类GPL246769606
GSE186716: Injury response of human lens epithelial cells ex-vivo

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-25

资源简介

人晶状体上皮细胞离体损伤应答数据集

Injury response of human lens epithelial cells ex-vivo

该数据集来自 NCBI GEO(GSE186716),研究人晶状体上皮细胞对机械损伤的离体应答。样本取自眼库供研究用的老年尸体眼,通过体外连续环形撕囊模拟白内障手术损伤,分别收集撕囊中央区上皮细胞、皮质纤维细胞及赤道部上皮细胞(即刻固定或培养24小时后固定),以 RNA later 稳定后进行高通量表达谱分析。数据可用于比较损伤即刻与培养后不同区域晶状体细胞的转录差异,探索白内障手术相关损伤反应机制(来源 NCBI)。

【数据集背景】

源站首次发布:Oct 27 202。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):本研究探讨人晶状体上皮细胞对机械损伤的应答。从捐赠给眼库供研究使用的尸体眼获得的人老年晶状体,接受体外撕囊术以模拟白内障手术中所受的损伤。使用连续环形撕囊技术剥离前囊膜,附着于前囊膜片(Rhexis)上的中央晶状体上皮细胞立即在 RNAlater 中稳定。随后去除纤维细胞,皮质纤维立即在 RNA later 中稳定。一只眼中附着于囊袋的剩余赤道部晶状体上皮细胞立即在 RNA later 中稳定,而另一只眼的赤道部晶状体上皮细胞培养 24 小时后在 RNAlater 中稳定。

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 0 B。

【主题与分类】

主题标签:GPL24676、9606。本站分类:眼及附器疾病。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE186716

【使用注意】

· 源站最后修改于 Mar 10 202,引用时请注意版本时效。

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源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE186716

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    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

本研究探讨人晶状体上皮细胞对机械性损伤的应答反应。从捐赠至眼库供研究使用的尸体眼获取的人老年晶状体,在体外接受模拟白内障手术中所受损伤的囊切开术。采用曲线形连续环形撕囊技术切开前囊膜,将附着于前囊膜片(撕囊片)上的中央晶状体上皮细胞立即稳定于RNAlater中。随后去除纤维细胞,并将皮质纤维立即稳定于RNAlater中。一只眼附着于囊袋的剩余赤道部晶状体上皮细胞立即稳定于RNAlater中,而另一只眼的赤道部晶状体上皮细胞则培养24小时后再稳定于RNAlater中。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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