GB20穴位针刺治疗对EAE模型小鼠影响的RNA测序数据集
该数据集来自NCBI，标题为GB20穴位针刺治疗对EAE模型小鼠的影响。研究利用RNA测序技术，探究针刺GB20穴位在EAE模型小鼠中的效应
基本信息
资源简介
GB20穴位针刺治疗对EAE模型小鼠影响的RNA测序数据集
GSE148759 数据集来自 NCBI，标题为“Effect of needling treatments on GB20 acupoint in EAE model mice”，即 GB20 穴位针刺治疗对 EAE 模型小鼠影响的研究数据。该数据集利用 RNA 测序技术，考察针刺 GB20 穴位在 EAE 模型小鼠中的效应，属于表达谱分析类数据，主题标签涉及高通量测序表达谱分析。数据集包含 1 个文件，样例文件为 GSE148759_series_matrix.txt.gz，作者为 Linqing、Miao，发布时间为 Apr 16 202。本站将其归类于眼及附器疾病 / 其他分类下，可供相关研究者在核对文件格式与字段编码后下载使用。
【数据集背景】
该数据集围绕针刺治疗在 EAE 模型小鼠中的作用展开。源站描述指出，研究目的是利用 RNA 测序技术探究针刺 GB20 穴位对 EAE 模型小鼠的影响。EAE 模型小鼠是研究中的实验对象，GB20 穴位是针刺干预的靶点，RNA 测序则是获取基因表达信息的技术手段。数据集标题与源站标题一致，均指向“针刺治疗对 EAE 模型小鼠 GB20 穴位的影响”这一研究主题。关于该研究的更详细背景，如 EAE 模型的具体构建方式、针刺参数设置及实验分组设计，源站未提供。
【数据内容】
数据集包含 1 个文件，文件样例为 GSE148759_series_matrix.txt.gz，属于 GZIP 压缩包格式。从文件命名看，其为系列矩阵文件，通常用于承载表达谱数据的样本与基因层面信息。主题标签包括 Expression profiling by high throughput sequencing、GPL24247 和 10090，分别对应高通量测序表达谱分析、平台编号与物种编号。数据集的具体样本数量、基因数量、表达值类型及矩阵字段构成，源站未提供。
【采集与来源】
数据来源站为 ncbi.nlm.nih.gov，即 NCBI。数据集作者为 Linqing、Miao，发布时间为 Apr 16 202。源站描述说明研究采用 RNA 测序方法，对针刺 GB20 穴位处理后的 EAE 模型小鼠进行表达谱分析。关于测序平台的具体型号、测序深度、建库方法、动物来源与伦理审批信息，源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于与针刺治疗、GB20 穴位干预及 EAE 模型小鼠相关的表达谱分析研究，可用于考察针刺处理对模型小鼠基因表达的影响。由于主题标签涉及高通量测序表达谱分析，也可作为高通量测序表达数据的参考资源。本站分类将其归入眼及附器疾病 / 其他，提示其可能与该分类下的研究场景相关。关于该数据集在其他具体疾病或通路研究中的适用性，源站未提供。
【使用方法】
使用时可先下载数据文件 GSE148759_series_matrix.txt.gz，按 GZIP 压缩包格式进行读取。建议先在小样本上核对字段与编码，确认无误后再批量接入分析流程。由于数据集仅包含 1 个文件，使用时应以该系列矩阵文件为主要数据入口。关于矩阵文件中具体字段的含义、注释信息的对应关系及推荐的分析流程，源站未提供。
【质量与限制】
数据集仅包含 1 个文件，文件数量有限，使用前需自行核对字段与编码的完整性。数据集发布时间为 Apr 16 202，其余时间信息源站未提供。关于样本量、重复设置、数据质控指标、缺失值情况及批次效应等信息，源站未提供。由于缺乏这些细节，使用者难以仅凭现有信息评估数据质量，需在下载后自行检查。
【引用与许可】
数据集作者为 Linqing、Miao，来源站为 ncbi.nlm.nih.gov。关于该数据集的引用格式、许可条款及使用限制，源站未提供。使用者在引用或再利用该数据集时，应遵循来源站的相关规定，并建议核对源站页面以获取准确的引用与许可信息。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE148759
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
目的：我们采用RNA测序研究针刺治疗对EAE模型小鼠GB20穴的影响。方法：采用Illumina Hiseq平台进行深度测序，生成13周龄雌性假对照组小鼠（SHAM）、注射MOG的EAE模型小鼠（MOG）、在GB20穴接受针刺治疗的EAE模型小鼠（GB20）及其对照穴GV16（GV16）的视网膜mRNA图谱，每组设三个重复。通过质量过滤的序列读数使用DESeq2 R包进行分析，以padj<0.05为标准鉴定差异表达基因。结果：RNA-seq共鉴定出234个差异表达基因（DEGs），其中MOG组与SHAM组比较，100个基因上调，134个基因下调。进一步分析显示，在MOG注射诱导的100个上调DEGs中，GB20治疗使24个DEGs发生逆转并显著下调，而GV16治疗使14个DEGs发生逆转并显著下调。然而，GV16治疗逆转的14个DEGs中有12个已包含在GB20的24个DEGs中。GV16治疗特有的其余2个DEGs为Gfap（胶质纤维酸性蛋白）和Fgf2（成纤维细胞生长因子2）。
关于MOG注射诱导的134个下调差异表达基因（DEGs），GB20治疗使12个DEGs发生逆转并显著上调，而GV16对照治疗仅使3个DEGs发生逆转并显著上调，且这3个DEGs均包含于GB20治疗的12个DEGs之中。结论：本研究首次报道了针刺GB20对EAE模型小鼠视网膜转录组具有调节作用，提示其可能成为治疗视神经炎的一种潜在途径。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
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