Fundus-AVSeg眼底动脉静脉分割数据集

抽象 视网膜动脉静脉血管与全身性慢性疾病和心血管疾病有关。因此,视网膜动脉静脉血管的准确定量分析是临床诊断的初步依据。大多数现有的人工智能 (AI) 方法都是数据驱动的。虽然已经发布了一些公共视网膜动脉静脉分割数据集,…

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DataCite Commons
2025-06-01 更新
浏览 17
医学影像fundus cameras
Fundus-AVSeg

基本信息

模态
医学影像
大小
0.212768224 GB
许可
CC BY 4.0
创建/更新时间
2025-06-01
版本
v2

资源简介

Fundus-AVSeg眼底动脉静脉分割数据集

【一句话概览】

本数据集是 figshare 公开的影像数据集,收录 1 个文件、合计 212.77 MB,主题涵盖 fundus cameras,可用于医学图像分割、检测与分类模型的训练与评测,CC BY 4.0 许可开放获取。

【数据集背景】

本数据集源站标题为《Fundus-AVSeg:用于基于 AI 的动脉静脉分割的眼底图像数据集》。源站首次发布:2025-04-30。

【数据内容】

源站原始描述:抽象 视网膜动脉静脉血管与全身性慢性疾病和心血管疾病有关。因此,视网膜动脉静脉血管的准确定量分析是临床诊断的初步依据。大多数现有的人工智能 (AI) 方法都是数据驱动的。虽然已经发布了一些公共视网膜动脉静脉分割数据集,但其数据质量并不令人满意。在本文中,我们为基于 AI 的动脉静脉分割建立了一个新的眼底图像数据集 Fundus-AVSeg。它由 100 张高分辨率眼底图像组成,并由专业眼科医生进行像素级手动注释。我们相信我们的 Fundus-AVSeg 将有利于视网膜动脉-静脉血管分割的进一步发展。 数据信息 Fundus-AVSeg 包含 100 张眼底图像,其中 40 张来自正常眼底,20 张来自糖尿病视网膜病变 (DR) 患者,20 张来自年龄相关性黄斑变性 (AMD),20 张来自青光眼。图像有两种分辨率:2656×1992 和 1280×1280。像素级手动注释类别包括动脉、静脉、动脉-静脉交叉和类别不确定的血管。还为每张图像提供了两个图像质量类别:低质量和高质量。 数据采集 Fundus-AVSeg 的数据来源是深圳眼科医院。所有 100 张眼底图像均来自深圳市眼科医院的影…

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 212.77 MB。数据集 DOI:10.6084/m9.figshare.27938034.v2。

【主题与分类】

源站学科分类:Ophthalmology。主题标签:fundus cameras。

【适用方向】

影像类数据可用于医学图像分析模型(检测、分割、分类)的训练与评测,也可用于标注质量与成像参数相关性的研究。

【获取与许可】

源站页面:https://figshare.com/articles/dataset/Fundus-AVSeg/27938034

使用许可:CC BY 4.0(https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/)。

规范引用:Deng, Zhuo (2024). Fundus-AVSeg:用于基于 AI 的动脉静脉分割的眼底图像数据集. figshare. Dataset

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使用方式

数据集获取(Figshare)

命令行下载

curl -L -o "Fundus-AVSeg.zip" "https://ndownloader.figshare.com/files/54093641"

文件清单

  • Fundus-AVSeg.zip(212.77 MB)

文件总体积 212.77 MB(源站 API 实测)。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

数据说明

抽象
视网膜动脉静脉血管与全身性慢性疾病和心血管疾病有关。因此,视网膜动脉静脉血管的准确定量分析是临床诊断的初步依据。大多数现有的人工智能 (AI) 方法都是数据驱动的。虽然已经发布了一些公共视网膜动脉静脉分割数据集,但其数据质量并不令人满意。在本文中,我们为基于 AI 的动脉静脉分割建立了一个新的眼底图像数据集 Fundus-AVSeg。它由 100 张高分辨率眼底图像组成,并由专业眼科医生进行像素级手动注释。我们相信我们的 Fundus-AVSeg 将有利于视网膜动脉-静脉血管分割的进一步发展。

数据信息
Fundus-AVSeg 包含 100 张眼底图像,其中 40 张来自正常眼底,20 张来自糖尿病视网膜病变 (DR) 患者,20 张来自年龄相关性黄斑变性 (AMD),20 张来自青光眼。图像有两种分辨率:2656×1992 和 1280×1280。像素级手动注释类别包括动脉、静脉、动脉-静脉交叉和类别不确定的血管。还为每张图像提供了两个图像质量类别:低质量和高质量。
数据采集
Fundus-AVSeg 的数据来源是深圳眼科医院。所有 100 张眼底图像均来自深圳市眼科医院的影像数据库。眼底图像由眼科医生使用蔡司VISUCAM200眼底相机或佳能眼底相机拍摄,这些都是眼底相机的主流产品。所有眼底图像都是在真实的临床诊断过程中生成的。所有伦理和实验程序和协议均由深圳眼科医院根据道德编号 2022KYPJ062 授予。
数据记录
Fundus-AVSeg 数据集已以压缩文件的形式上传到 Figshare。解压后的文件包含两个文件夹和一个Microsoft Office Excel 列表,以及两个 txt 格式的文件,分别命名为 ‘’‘‘images’’‘’、‘’‘‘annotation’’‘’ 、‘’‘‘metadata.xlsx’’‘’、‘‘training.txt’’‘’ 和 ‘’‘‘testing.txt’’‘’ 。在 ‘’‘‘images’’‘’ 文件夹中,有 100 张眼底图像。图像被命名为 ‘’‘‘n_D/A/G/N.png“,其中 ‘’’‘n’’‘’ 表示眼底图像的数量,‘’‘‘D’’‘’、‘’‘‘A’’‘’、‘‘G’’‘’ 和 ‘’‘‘N’’‘’ 代表 ‘’‘‘DR’’‘’、‘‘AMD’’‘’、‘‘青光眼’’‘’ 和 ‘’‘‘正常’’‘’。‘’‘‘annotation’’‘’ 文件夹包含 100 张对应的带注释的图像,这些图像按照相同的规则命名,其中该文件夹中的特定图像是 ‘’‘‘images’’‘’ 中同名图像的基本事实。“metadata.xlsx”是一个 Excel 文件,其中包含以下信息:图像名称、眼睛 ID、疾病类型和图像质量。‘’‘‘training.txt’’‘’ 和 ‘’‘‘testing.txt’’‘’ 文件分别存储用于训练和测试的特定图像名称,按照数据集的 8:2 分割。请注意,当前的数据拆分策略是我们推荐的,可以根据不同的研究目的进行更改。
使用说明
完整的数据集可通过提供的链接下载。用户可以根据其特定的研究设计灵活地划分数据集。预计用户将在他们的研究中引用这篇论文,并认识到数据集对他们研究的贡献。
代码可用性
本研究中提到的代码可以在 https://github.com/AI-thpremed/Basic-Seg-Experiment 中找到。

许可

CC BY 4.0

引用

学术使用请引用 DOI 10.6084/m9.figshare.27938034.v2(source: https://figshare.com/articles/dataset/Fundus-AVSeg/27938034)。

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