硅油填充后激光治疗视盘小凹继发黄斑视网膜脱离数据集

该数据集来自 frontiersin.figshare.com,包含一份 Excel 数据表,围绕视网膜脱离患者玻璃体液与硅油填充后视网膜毒性的蛋白质组学研究

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2023-05-31 更新
浏览 9
蛋白质分类data-independent acquisition (DIA)quantitative proteomicssilicone oilrhegmatogenous retinal detachment (RRD)vitreous
Data from: Gas tamponade followed by laser treatment for macular retinal detachment secondary to optic pit

基本信息

模态
蛋白质
大小
0.000029587 GB
任务类型
分类
许可
CC BY 4.0
创建/更新时间
2023-05-31
版本
v1

资源简介

硅油填充后激光治疗视盘小凹继发黄斑视网膜脱离数据集

DataSheet1_DIA Comparative Proteomic Analysis of Retro-oil Fluid and Vitreous Fluid From Retinal Detachment Patients.xlsx

该数据集来自 frontiersin.figshare.com,包含一份 Excel 数据表,围绕视网膜脱离患者玻璃体液与硅油填充后视网膜毒性的蛋白质组学研究。源站描述显示,研究采集 27 例患者(27 眼)的玻璃体液样本,其中 12 眼用于 data-independent acquisition (DIA) 分析并分为四组,其余 15 眼用于酶联免疫吸附分析。数据可用于探索硅油填充后视网膜毒性的潜在机制及玻璃体液蛋白质组特征(来源 figshare,CC BY 4.0 许可)。

【数据集背景】

配套论文《Proteomic analysis of human vitreous fluid by fluorescence-based difference gel electrophoresis (DIGE): a new strategy for identifying potential candidates in the pathogenesis of proliferative diabetic retinopathy》发表于 Diabetologia(2007),DOI:10.1007/s00125-007-0627-y。源站首次发布:2021-12-03。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):目的:已有报道显示视网膜脱离患者在接受眼内硅油(SiO)填充后出现不明原因的视力丧失,但其潜在机制尚不清楚。本研究旨在探讨视网膜脱离患者眼内 SiO 填充后视网膜毒性的机制。方法与结果:采集 27 例患者(27 眼)的玻璃体液样本。其中 12 眼用于 data-independent acquisition (DIA) 分析,分为四组:孔源性视网膜脱离行平坦部玻璃体切除术(PPV)(RD 组)、视网膜成功复位后取出 SiO(SO 组)、视网膜成功复位并采用无菌空气填充后行白内障手术(FA 组)以及视网膜前膜行 PPV(ERM 组)。其余 15 眼用于酶联免疫吸附分析。DIA 结合二维

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 29.59 KB。数据集 DOI:10.3389/fmolb.2021.763002.s001。

【主题与分类】

源站学科分类:Biochemistry、Molecular Biology、Enzymes、Protein Trafficking、Proteomics and Intermolecular Interactions (excl. Medical Proteomics)、Receptors and Membrane Biology。主题标签:data-independent acquisition (DIA)、quantitative proteomics、silicone oil、rhegmatogenous retinal detachment (RRD)、vitreous。本站分类:眼及附器疾病。

【适用方向】

源站学科分类标注为 Biochemistry、Molecular Biology、Enzymes、Protein Trafficking、Proteomics and Intermolecular Interactions (excl. Medical Proteomics)、Receptors and Membrane Biology。

【获取与许可】

源站页面:https://frontiersin.figshare.com/articles/dataset/DataSheet1_DIA_Comparative_Proteomic_Analysis_of_Retro-oil_Fluid_and_Vitreous_Fluid_From_Retinal_Detachment_Patients_xlsx/17119622

使用许可:CC BY 4.0(https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/)。

规范引用:Shu, Yiyang; Gao, Min; Zhou, Yifan; Liu, Haiyun; Sun, Xiaodong (2021). DataSheet1_DIA Comparative Proteomic Analysis of Retro-oil Fluid and Vitreous Fluid From Retinal Detachment Patients.xlsx. Frontiers. Dataset

【使用注意】

· 源站最后修改于 2023-05-31,引用时请注意版本时效。

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使用方式

数据集获取(Figshare)

命令行下载

curl -L -o "DataSheet1_DIA Comparative Proteomic Analysis of Retro-oil Fluid and Vitreous Fluid From Retinal Detachment Patients.xlsx" "https://ndownloader.figshare.com/files/31652195"

文件清单

  • DataSheet1_DIA Comparative Proteomic Analysis of Retro-oil Fluid and Vitreous Fluid From Retinal Detachment Patients.xlsx(29.59 KB)

文件总体积 29.59 KB(源站 API 实测)。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

数据说明

目的:已有报道显示,视网膜脱离患者在接受眼内硅油(SiO)填充术后出现不明原因的视力丧失,但其潜在机制尚不清楚。本研究旨在探讨视网膜脱离患者眼内SiO填充术后视网膜毒性的机制。方法与结果:采集27例患者(27只眼)的玻璃体液样本。其中12只眼用于数据非依赖性采集(DIA),分为四组:孔源性视网膜脱离行平坦部玻璃体切除术(RD组)、视网膜成功复位后取出SiO(SO组)、视网膜成功复位后行无菌空气填充的白内障手术(FA组)、以及视网膜前膜行平坦部玻璃体切除术(ERM组)。其余15只眼用于酶联免疫吸附测定分析。将DIA与二维液相色谱-串联质谱联用,以发现玻璃体蛋白质组中的表达变化。分析了平均质谱数、统计学差异表达蛋白、基因本体(GO)、通路表征及蛋白质相互作用。

GO分析显示,与对照组或FA组相比,SO组在突触组织、细胞黏附和细胞迁移调控等蛋白质类别上存在差异表达(p 结论:识别出可能导致视力丧失的新分子特征和通路,这些特征和通路可能与SiO毒性相关。转铁蛋白可能是SiO填充术后视力结局的潜在生物标志物。

许可

CC BY 4.0

引用

学术使用请引用 DOI 10.3389/fmolb.2021.763002.s001(source: https://frontiersin.figshare.com/articles/dataset/DataSheet1_DIA_Comparative_Proteomic_Analysis_of_Retro-oil_Fluid_and_Vitreous_Fluid_From_Retinal_Detachment_Patients_xlsx/17119622)。

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