衰老与解剖位置对人视网膜基因表达的影响数据集

主题标签:视网膜、基因表达、衰老、解剖位置、眼及附器疾病。本数据集为眼及附器疾病领域公开数据集,主题涵盖视网膜。本数据集为眼病领域的基因组公开数据集,来源:google_dataset,主题涵盖视网膜。

google_dataset
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基因组分类视网膜基因表达衰老解剖位置眼及附器疾病
Data from: Effects of Aging and Anatomic Location on Gene Expression in Human Retina

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-22

资源简介

衰老与解剖位置对人视网膜基因表达的影响数据集

该数据集英文名为 Data from: Effects of Aging and Anatomic Location on Gene Expression in Human Retina,由 Hui Cai 与 Lucian Del Priore 于 2015 年发布,来源站为 ebi.ac.uk,对应 ArrayExpress 实验编号 E-GEOD-32614。数据集主题聚焦人视网膜的基因表达,考察衰老与解剖位置两个因素对表达谱的影响,在分类上归入眼及附器疾病领域的其他类别。整体而言,这是一份面向眼科基础与转化研究的公开表达谱数据资源,可供研究者围绕视网膜衰老相关分子变化及区域差异开展二次分析。

【数据集背景】

视网膜是眼及附器的重要组成部分,其基因表达状态随年龄与解剖位置而变化,这一过程与多种视网膜退行性改变和眼及附器疾病的发生发展密切相关。该数据集以“衰老”和“解剖位置”为核心变量,针对人视网膜组织开展基因表达层面的观察,旨在为理解视网膜不同区域在衰老过程中的分子差异提供数据基础。数据集由 Hui Cai 与 Lucian Del Priore 于 2015 年发布,并通过 ArrayExpress 平台以 E-GEOD-32614 编号公开,属于眼及附器疾病领域中的公开数据集。

【数据内容】

数据集的主题标签包括视网膜、基因表达、衰老、解剖位置以及眼及附器疾病,内容围绕人视网膜样本的基因表达谱展开,重点反映衰老因素与解剖位置因素对表达水平的影响。数据以基因表达实验数据的形式组织,属于公开可获取的数据集资源。关于样本数量、检测平台、基因数目、分组设计等具体内容,源站未提供。

【采集与来源】

该数据集来源站为 ebi.ac.uk,源站描述中给出的引用信息为:Hui Cai; Lucian Del Priore (2015). Effects of Aging and Anatomic Location on Gene Expression in Human Retina [Dataset],对应链接 https://www.ebi.ac.uk/arrayexpress/experiments/E-GEOD-32614/。数据通过 ArrayExpress 实验条目对外发布。关于样本采集地点、供体信息、伦理审批及具体实验流程,源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于视网膜基因表达相关的基础与转化研究,例如探讨衰老对视网膜转录组的影响、比较不同解剖位置视网膜区域的表达差异,以及作为眼及附器疾病研究的参考表达谱资源。也可用于方法学层面的表达数据分析练习与结果复现。关于具体疾病关联或临床应用的结论,源站未提供。

【使用方法】

使用者可通过源站给出的 ArrayExpress 实验编号 E-GEOD-32614 访问并获取该数据集,按照 ArrayExpress 平台的一般流程下载数据并进行表达谱分析。关于数据文件格式、预处理步骤、归一化方法及分析建议,源站未提供。

【质量与限制】

该数据集为公开数据集,其发布信息包含标题、作者、年份与来源链接。关于样本量、数据完整性、批次效应、技术重复及验证情况等质量相关信息,源站未提供。使用时应结合源站条目自行评估数据适用性。

【引用与许可】

引用该数据集时,应使用源站描述中给出的引用信息:Hui Cai; Lucian Del Priore (2015). Effects of Aging and Anatomic Location on Gene Expression in Human Retina [Dataset],并注明来源 https://www.ebi.ac.uk/arrayexpress/experiments/E-GEOD-32614/。关于该数据集的许可条款与使用限制,源站未提供。

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使用方式

数据集获取

源站:https://ebi.ac.uk/arrayexpress/experiments/E-GEOD-32614

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

Hui Cai; Lucian Del Priore (2015). Effects of Aging and Anatomic Location on Gene Expression in Human Retina [Dataset]. https://www.ebi.ac.uk/arrayexpress/experiments/E-GEOD-32614/

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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