数据集：α-crystallin缺失对斑马鱼晶状体发育的影响-107380

数据集获取

源站：https://search.dataone.org/view/sha256%3Ad1df34d8a074de59b5ea21267c9ea1195460d21e552fd41b67c1c33a0c344df3

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

α-晶体蛋白小热休克蛋白有助于维持脊椎动物眼晶状体的透明度和折射特性，并防止蛋白质聚集，否则会导致晶状体白内障，这是人类失明的主要原因。关于α-晶体蛋白在早期晶状体发育中可能发挥的作用，文献中存在相互矛盾的数据。在本研究中，我们使用CRISPR基因编辑技术产生了斑马鱼品系，其三个α-晶体蛋白基因（cryaa、cryaba和cryabb）中各有一个发生突变，以阻止蛋白质产生。通过质谱分析检测了每种α-晶体蛋白的缺失情况，并使用微分干涉相差显微镜和组织学评估了晶状体表型。αA-晶体蛋白的缺失在3和4 dpf的幼体晶状体中产生了多种严重程度不一的晶状体缺陷，但对正常纤维细胞去核几乎没有实质性影响。αBa-晶体蛋白的缺失未产生明显的晶状体缺陷。我们的cryabb突变体产生了一种截短的αBb-…，该数据集包括经PTU处理的斑马鱼幼体大体解剖的显微照片，以及显示晶状体的其眼睛的微分干涉相差显微镜图像。

其中包括野生型鱼、三个α-晶状体蛋白基因（cryaa、cryaba和cryabb）突变体以及cryaa的crispant在受精后3天和4天的图像集。所有幼鱼均以45X总放大倍数成像，眼睛以200X总放大倍数成像。还包括在每个放大倍数下拍摄的 stage micrometer 图像。这些测微尺图像用于测量所有图像中幼鱼的总长度和晶状体直径。这些图像用于分析晶状体大小与体长的关系，并量化晶状体缺陷的存在情况，相关结果见所附手稿中的图4和图5。有三个数据集不包含幼鱼图像，仅用于量化晶状体缺陷的存在情况：“112221 cryaa 3 dpf”、“102620 crispants 3 dpf”和“121421 crispants 4 dpf”。量化数据和R scr

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。