数据集：基于商业基因检测数据的犬进行性视杆视锥变性-进行性视网膜萎缩与柯利眼异常全球频率分析

数据集获取

源站：https://search.dataone.org/view/sha256%3Ab44e4468584d05cc9c7b3089a2963b02ad783d3669c222fa2ed392cebab66f2b

标准获取流程：

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数据说明

已鉴定出数百种与犬类性状和疾病相关的遗传变异，并有商业检测提供。然而，关于等位基因和基因型频率在长时间连续时期内的地理分布及变化情况尚缺乏数据。本研究利用了一家商业基因检测公司（Optigen/Wisdom Panel，Mars Petcare Science & Diagnostics）提供的大量基因型数据，这些数据来自接受进行性视杆-视锥变性-进行性视网膜萎缩（prcd-PRA）G>A错义PRCD变异检测的犬只（n = 86,667）以及科利眼异常（CEA）相关NHEJ1缺失检测的犬只（n = 33,834）。这些数据通过卡方拟合优度检验、时间趋势图形分析和回归模型进行分析，以评估检测结果随时间的变化情况。研究结果跨越十五年，代表了82个国家和67个品种/品种混合。

两种疾病在基因型频率上均表现出显著差异（prc…的p = 2.7 × 10⁻¹⁵²）。本研究数据包括由一家商业基因检测公司（OptiGen, LLC，于2018年被Mars Petcare收购）在2004年至2019年间检测的prcd-PRA（n=86,667只犬）和CEA（n=33,834只犬）的基因型状态。这些数据经过统计分析（卡方拟合优度检验、逻辑回归建模、多项回归建模），以确定等位基因和基因型频率随时间变化的显著性，以及犬种、地理位置、时间进展和流行度对犬只罹患任一疾病或处于携带者状态的总体可能性的影响。# 来自Clark等人的“利用商业基因检测数据对犬进行性视杆-视锥变性-进行性视网膜萎缩和柯利眼异常的全球频率分析”的基因型和样本数据 ## 数据及文件结构描述 由主人提交至商业基因检测公司OptiGen, LLC和[此处原文不完整]的家犬样本的基因型和元信息

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。