用于研究眼病的细胞采集数据集

数据集获取

源站：https://clinicaltrials.gov/study/NCT01432847

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

疾病：视网膜疾病、AMD、视网膜变性、视网膜色素变性。本研究将建立一个生物样本库，用于生成诱导多能干细胞（iPS细胞），这些细胞将用于确定潜在致盲性眼病的分子机制，包括但不限于：Best卵黄样营养不良（Best病）；晚发性视网膜变性（L-ORD）；年龄相关性黄斑变性（AMD）；Leber先天性黑矇（LCA）；Joubert综合征；X连锁视网膜色素变性（RP）；眼皮肤白化病；伴ABCA4基因突变的Stargardt病；Waardenburg综合征、缺损、增强型S视锥综合征（ESCS）、脊髓小脑共济失调7型（SCA7）以及与MITF、PAX2或PAX6基因突变相关的眼病。可从视网膜疾病患者以及年龄、性别和种族匹配的健康参与者中采集皮肤成纤维细胞、唾液、毛发角质形成细胞、尿液和/或血细胞。尽管可能会开展涉及这些患者多种不同眼细胞类型的研究，但绝大多数工作将集中在视网膜色素上皮（RPE）和神经视网膜上。

由视网膜疾病患者和健康志愿者的iPS细胞生成的RPE和/或神经视网膜细胞将用于分析疾病发生和发展所涉及的分子机制。此外，iPS细胞来源的眼部细胞将用于开展高通量（HTP）药物筛选，旨在抑制疾病的分子表型，并鉴定这些疾病的潜在治疗药物。目标：本研究的主要目标是生成可分化为眼部细胞类型的参与者iPS细胞，用于研究眼部疾病的分子机制并开发治疗方法。该目标将分三个阶段实施。首先，本研究将建立一个生物样本库，收集眼病患者及无眼病的匹配对照者的成纤维细胞、角质形成细胞、尿源细胞和/或血细胞。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。