年龄相关性黄斑变性患者咽部微生物组数据集
该数据集包含245名年龄相关性黄斑变性患者和386名对照者的咽部微生物组测序数据,通过Illumina技术对16S rRNA基因V3-V6区域进行高通量测序,以文本形式的基因序列数据呈现,主要用于探究咽部微生物群与年龄相关性黄斑变性之间的关联,识别潜在致病菌属,为眼科疾病机制和微生物组学研究提供数据支持。

基本信息
资源简介
年龄相关性黄斑变性患者咽部微生物组数据集
【数据集背景】
本数据集源站标题为《Human pharyngeal microbiota in age-related macular degeneration》。配套论文《Human pharyngeal microbiota in age-related macular degeneration》发表于 PLOS ONE(2018),DOI:10.1371/journal.pone.0201768。源站首次发布:2018-08-08。
【数据内容】
源站原始描述:Background While the aetiology of age-related macular degeneration (AMD)—a major blinding disease—remains unknown, the disease is strongly associated with variants in the complement factor H (CFH) gene. CFH variants also confer susceptibility to invasive infection with several bacterial colonizers of the nasopharyngeal mucosa. This shared susceptibility locus implicates complement deregulation as a common disease mechanism, and suggests the possibility that microbial interactions with host compl…
【数据结构与技术规格】
文件数 12 个,合计 836.02 KB。pone.0201768.s001.docx:application/vnd.openxmlformats-officedocument.wordprocessingml.document,165.76 KB。pone.0201768.s005.docx:application/vnd.openxmlformats-officedocument.wordprocessingml.document,129.87 KB。pone.0201768.s006.docx:application/vnd.openxmlformats-officedocument.wordprocessingml.document,98.00 KB。数据集 DOI:10.1371/journal.pone.0201768。
【主题与分类】
源站学科分类:Medicine、Microbiology、Genetics、Molecular Biology、Biotechnology、Cancer。主题标签:susceptibility locus implicates complement deregulation、245 AMD patients、V 3-V region、complement factor H、Results High-throughput Illumina sequencing、age-related macular degeneration、Singapore Health Clinical、Human pharyngeal microbiota、age-related macular degeneration Background、RNA。
【适用方向】
源站学科分类标注为 Medicine、Microbiology、Genetics、Molecular Biology、Biotechnology、Cancer。
【获取与许可】
源站页面:https://plos.figshare.com/articles/dataset/Human_pharyngeal_microbiota_in_age-related_macular_degeneration/6947408
使用许可:CC BY 4.0(https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/)。
规范引用:Xin Pei Ho, Eliza; Ming Gemmy Cheung, Chui; Sim, Shuzhen; Wenhan Chu, Collins; Wilm, Andreas; Lin, Clarabelle Bitong; et al. (2018). Human pharyngeal microbiota in age-related macular degeneration. PLOS ONE. Dataset
【使用注意】
· 源站最后修改于 2023-05-31,引用时请注意版本时效。
下载信息
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使用方式
数据集获取(Figshare)
按页面 Download 按钮获取。
数据说明
该数据集是一个微生物组学数据集,旨在研究人类咽部微生物群与年龄相关性黄斑变性(AMD)之间的关联。数据集包含245名AMD患者和386名对照者的咽部微生物样本,通过Illumina高通量测序技术对16S rRNA基因的V3-V6区域进行测序,以在属水平上全面描述微生物组成。数据来源为新加坡的临床研究,经过伦理委员会批准。研究通过平均丰度和差异丰度分析,识别了与AMD健康与疾病状态相关的候选菌属(如Prevotella和Gemella),为AMD的微生物触发机制提供了初步证据,主要应用于眼科疾病、微生物组学及宿主-微生物相互作用的研究方向。
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