小鼠泪腺24小时光暗时间序列bulk RNA-seq数据集

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE333177

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

泪腺是负责泪液分泌的主要外分泌器官，对维持眼表稳态至关重要。然而，该组织的时间分辨转录组资源仍然有限。在此，我们从维持在受控12：12明暗周期下的雄性C57BL/6J小鼠眶外泪腺中生成了批量RNA-seq时间序列数据集。在24小时周期内以3小时间隔采集组织样本，获得八个时间点，每个时间点三个生物学重复。文库由总RNA制备，并测序为150 bp双端读长。该数据集为泪腺生物学、眼表生理学以及特定明暗条件下基因表达动态的下游研究提供了可重复使用的时间转录组资源。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。