HSV-1感染原代角膜上皮细胞中miRNA与circRNA表达谱及相互作用网络的整合分析数据集
该数据集包含通过微阵列技术获取的HSV-1感染原代角膜上皮细胞与对照组的circRNA和miRNA表达谱数据，属于基因表达模态数据。它系统地揭示了感染过程中非编码RNA的差异表达情况，并构建了circRNA-miRNA相互作用网络，旨在探索这些分子在单纯疱疹病毒性角膜炎发病机制中的潜在作用，为病毒性眼病的分子机制研究和生物标志物发现提供了基础数据支持。
基本信息
资源简介
该数据集通过微阵列分析技术，比较了HSV-1感染与未感染的原代人角膜上皮细胞中环状RNA（circRNA）和微小RNA（miRNA）的表达谱。研究共检测到332个circRNA和16个miRNA上调，80个circRNA和6个miRNA下调（变化倍数≥2.0，p<0.05）。通过生物信息学分析，预测了差异表达circRNA的潜在功能及其包含的miRNA响应元件（MRE），构建了circRNA与miRNA的相互作用网络。研究进一步对差异表达circRNA的亲本基因进行了GO功能注释和KEGG通路富集分析，以揭示其在HSV-1感染中的潜在作用。其中，miR-181b-5p、miR-338-3p、miR-635和miR-222-3p被鉴定为与多个差异表达circRNA相互作用的关键miRNA。该数据集为探索circRNA-miRNA相互作用在单纯疱疹病毒性角膜炎（HSK）发病机制中的潜在作用提供了重要资源，主要应用于病毒性角膜炎的分子机制研究、非编码RNA功能探索以及潜在的诊断标志物或治疗靶点发现。
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使用方式
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数据说明
该数据集通过微阵列分析技术，比较了HSV-1感染与未感染的原代人角膜上皮细胞中环状RNA（circRNA）和微小RNA（miRNA）的表达谱。研究共检测到332个circRNA和16个miRNA上调，80个circRNA和6个miRNA下调（变化倍数≥2.0，p<0.05）。通过生物信息学分析，预测了差异表达circRNA的潜在功能及其包含的miRNA响应元件（MRE），构建了circRNA与miRNA的相互作用网络。研究进一步对差异表达circRNA的亲本基因进行了GO功能注释和KEGG通路富集分析，以揭示其在HSV-1感染中的潜在作用。其中，miR-181b-5p、miR-338-3p、miR-635和miR-222-3p被鉴定为与多个差异表达circRNA相互作用的关键miRNA。该数据集为探索circRNA-miRNA相互作用在单纯疱疹病毒性角膜炎（HSK）发病机制中的潜在作用提供了重要资源，主要应用于病毒性角膜炎的分子机制研究、非编码RNA功能探索以及潜在的诊断标志物或治疗靶点发现。
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