phs000836:单细胞分析计划-转录组(SCAP-T)(USC)

本站将其归类于眼病 / 物像不等方向,主题标签为 Case Set。该数据可用于单细胞转录组层面的病例分析及相关研究,具体样本量、物种、组织来源与测序平台等信息源站未提供(来源 ncbi.nlm.nih.gov)

dbgap
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基因组分类Case Set
phs000836: Single Cell Analysis Program - Transcriptome (SCAP-T) (USC)

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-07

资源简介

phs000836:单细胞分析计划-转录组(SCAP-T)(USC)

phs000836 是一个以单细胞转录组分析为核心的数据集,英文全称为 Single Cell Analysis Program - Transcriptome (SCAP-T) (USC)。该数据集在来源站 ncbi.nlm.nih.gov 上以 dbGaP study 的形式发布,类型标注为 Case Set。本站将其归类于眼病 / 物像不等方向,主题标签同样为 Case Set。从现有信息来看,该数据可用于单细胞转录组层面的病例分析及相关研究,适合关注单细胞水平基因表达特征、病例组样本转录组差异等方向的研究者参考使用。需要说明的是,关于该数据集的具体样本量、物种、组织来源与测序平台等细节,源站未提供,因此本介绍仅能围绕已知的归类、来源与主题标签展开,无法对数据规模和技术参数作出进一步说明。

【数据集背景】

该数据集属于单细胞分析项目下的转录组数据,英文名称为 Single Cell Analysis Program - Transcriptome (SCAP-T) (USC)。从命名可以看出,其与单细胞转录组研究相关,且带有 USC 标识,提示其可能由相关机构参与或提交。来源站为 ncbi.nlm.nih.gov,以 dbGaP study 的形式存在,说明其属于 dbGaP 体系下的研究型数据资源。dbGaP 通常用于归档与人类遗传学、基因组学相关的研究数据,因此该数据集在性质上更偏向于研究用途而非普通展示型数据。本站将其归入眼病 / 物像不等方向,主题标签为 Case Set,表明其在应用分类上被视作病例集合,可能用于病例相关的比较或分析。关于该项目的具体研究背景、立项机构、研究目标等,源站未提供。

【数据内容】

该数据集的核心内容为单细胞转录组数据,主题标签为 Case Set,说明其以病例样本为主要组织方式。单细胞转录组通常用于刻画单个细胞层面的基因表达谱,可用于识别细胞类型、状态差异以及病例样本中的表达异常。然而,关于该数据集具体包含多少样本、涉及哪些物种、来自何种组织、使用何种测序平台、覆盖哪些基因或转录本等信息,源站未提供。因此,无法对其数据内容的规模、粒度和技术特征作出进一步描述。本站分类将其指向眼病 / 物像不等方向,但该分类与数据内部具体内容之间的对应关系,源站未提供。

【采集与来源】

该数据集来源于 ncbi.nlm.nih.gov,以 dbGaP study 形式发布,类型为 Case Set。dbGaP 作为来源站上的数据归档体系,通常承载研究项目提交的数据。该数据集的英文名称中包含 Single Cell Analysis Program - Transcriptome (SCAP-T) (USC),提示其与单细胞分析项目相关,并可能涉及 USC 相关机构。除此之外,关于样本采集方式、采集时间、采集地点、伦理审批、知情同意、受试者特征、病例定义与对照设置等具体采集与来源信息,源站未提供。

【适用场景】

基于现有信息,该数据集可用于单细胞转录组层面的病例分析及相关研究。由于主题标签为 Case Set,其较适合用于病例组样本的转录组特征探索,例如在单细胞水平上考察病例样本的细胞组成或表达模式。本站将其归类于眼病 / 物像不等方向,因此对眼病或物像不等相关研究有兴趣的研究者,可能将其作为潜在参考数据。但需要强调的是,具体适用场景取决于数据内部实际包含的样本类型、组织来源与实验设计,而这些信息源站未提供,因此无法进一步明确其适用范围或推荐具体分析任务。

【使用方法】

该数据集以 dbGaP study 形式发布,通常需要通过来源站 ncbi.nlm.nih.gov 的相关访问流程获取。dbGaP 数据往往涉及受控访问机制,使用者可能需要按照来源站要求提交申请并获得授权后方可使用。关于该数据集的具体下载方式、文件格式、数据组织方式、配套文档、分析流程或推荐工具等,源站未提供。因此,无法给出详细的操作步骤或技术建议。使用者在获取数据后,应结合自身研究目的和来源站提供的说明进行合规使用。

【质量与限制】

该数据集在来源站以 dbGaP study 形式发布,类型为 Case Set,主题标签为 Case Set。关于其数据质量、测序深度、覆盖度、批次效应、样本排除标准、质控指标等信息,源站未提供。其限制之一在于,当前可获取的信息仅包括英文名称、来源站、类型与本站分类,缺乏样本量、物种、组织来源与测序平台等关键参数,因此难以对数据质量与适用边界作出完整评估。此外,本站分类为眼病 / 物像不等方向,但该分类是否与数据实际内容完全一致,源站未提供进一步说明。

【引用与许可】

该数据集来源于 ncbi.nlm.nih.gov,以 dbGaP study 形式发布。关于其具体引用方式、文献出处、数据提交者、许可协议、使用条款、访问限制与再分发规定等,源站未提供。使用者在引用或使用该数据集时,应遵循来源站 ncbi.nlm.nih.gov 的相关政策与要求,并依据 dbGaP 的通用规范进行合规访问与使用。由于源站未提供具体许可信息,无法在此给出明确的引用格式或授权范围。

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源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/projects/gap/cgi-bin/study.cgi?study_id=phs000836

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    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
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数据说明

dbGaP study (Case Set).

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