phs001095:T2D-GENES 多族裔外显子组测序研究:Ashkenazi

源站将其描述为一项病例对照研究,主题标签为 Case-Control。数据围绕 T2D-GENES 项目中的 Ashkenazi 人群外显子组测序展开,可用于 2 型糖尿病相关的病例对照分析

dbgap
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基因组分类Case-Control
phs001095: T2D-GENES Multi-Ethnic Exome Sequencing Study: Ashkenazi

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-07

资源简介

phs001095:T2D-GENES 多族裔外显子组测序研究:Ashkenazi

phs001095: T2D-GENES Multi-Ethnic Exome Sequencing Study: Ashkenazi 是 NCBI(ncbi.nlm.nih.gov)dbGaP 收录的一项病例对照研究数据集,归属于内分泌系统疾病 / 2型糖尿病分类。该数据集围绕 T2D-GENES 项目中的 Ashkenazi 人群外显子组测序展开,主题标签为 Case-Control,可用于 2 型糖尿病相关的病例对照分析。作为一项以外显子组测序为核心手段的研究资源,它为探索该人群在 2 型糖尿病易感性方面的遗传因素提供了数据基础。以下从数据集背景、数据内容、采集与来源、适用场景、使用方法、质量与限制以及引用与许可等方面进行介绍。

【数据集背景】

该数据集来源于 T2D-GENES 项目,全称为 T2D-GENES Multi-Ethnic Exome Sequencing Study: Ashkenazi。T2D-GENES 是一个多族裔外显子组测序研究项目,本数据集对应其中的 Ashkenazi 人群部分。源站将其描述为一项病例对照研究(Case-Control),主题标签同样为 Case-Control。数据集被归类于内分泌系统疾病 / 2型糖尿病,说明其研究目标与 2 型糖尿病的遗传机制相关。关于该项目的具体立项背景、研究机构、资助来源等信息,源站未提供。

【数据内容】

该数据集的核心内容是 Ashkenazi 人群的外显子组测序数据,属于 T2D-GENES 多族裔外显子组测序研究的组成部分。由于源站将其标注为病例对照研究,可以判断数据中应包含病例与对照两类样本,用于比较分析。数据围绕 2 型糖尿病展开,可用于相关的病例对照分析。关于样本量、测序深度、覆盖基因范围、变异位点数量、表型字段等具体内容,源站未提供。

【采集与来源】

数据来源站为 ncbi.nlm.nih.gov,具体收录于 dbGaP。dbGaP 是美国国家生物技术信息中心(NCBI)维护的基因型与表型数据库,用于存储和分发基因型与表型关联研究数据。源站将该研究描述为病例对照研究。关于样本采集地点、采集时间、采集流程、伦理审批信息、测序平台与具体实验方案等,源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于 2 型糖尿病相关的病例对照分析,尤其是针对 Ashkenazi 人群的外显子组层面遗传变异研究。潜在应用方向包括:在病例与对照之间比较外显子组变异频率,识别与 2 型糖尿病相关的候选基因或变异;作为 T2D-GENES 多族裔研究的一部分,参与跨族裔比较分析;为 2 型糖尿病的遗传易感性研究提供 Ashkenazi 人群的数据支持。关于该数据集是否已被用于特定发表成果或具体分析流程,源站未提供。

【使用方法】

该数据集通过 dbGaP 平台提供访问。dbGaP 通常要求用户提交数据访问申请,经数据访问委员会批准后方可获取受控访问数据。具体的数据下载方式、文件格式、分析工具建议、配套文档等,源站未提供。使用者应遵循 dbGaP 的标准访问流程获取数据。

【质量与限制】

该数据集为 dbGaP 收录的病例对照研究,主题标签为 Case-Control。关于数据质量指标、缺失率、批次效应、样本排除标准、群体分层控制方法等质量控制信息,源站未提供。由于仅涉及 Ashkenazi 人群,其结果在外推至其他族裔时需谨慎。关于该数据集的具体局限性说明,源站未提供。

【引用与许可】

该数据集来源于 ncbi.nlm.nih.gov 的 dbGaP,使用时应遵循 dbGaP 的数据访问与使用政策。关于具体的引用文献、许可条款、数据使用协议细节等,源站未提供。使用者在发表基于该数据集的研究成果时,应按照 dbGaP 的要求进行引用和致谢。

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使用方式

数据集获取

源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/projects/gap/cgi-bin/study.cgi?study_id=phs001095

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

dbGaP study (Case-Control).

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