患者脂肪干细胞来源脂肪细胞预测抗糖尿病药物反应遗传变异数据集
该数据集包含肥胖患者脂肪干细胞来源脂肪细胞的基因表达与SNP数据，揭示影响抗糖尿病药物罗格列酮反应的遗传变异。
基本信息
资源简介
患者脂肪干细胞来源脂肪细胞预测抗糖尿病药物反应遗传变异数据集
【一句话概览】
本数据集是 NCBI 公开的组学数据集，收录 1 个文件，主题涵盖 GPL11154、9606，可用于生物标志物发现与分子分型研究。
【数据集背景】
本数据集源站标题为《Patient adipose stem cell-derived adipocytes reveal genetic variation that predicts anti-diabetic drug response》。源站首次发布：Jun 06 201。
【数据内容】
源站原始描述：Thiazolidinedione drugs (TZDs) target the transcriptional activity of PPARg to reverse insulin resistance in type 2 diabetes, but side effects limit their clinical use. Here, using human adipose stem cell-derived adipocytes, we demonstrate that single-nucleotide polymorphisms (SNPs) were enriched at sites of patient-specific PPARg binding, which correlated with the individual-specific effects of TZD rosiglitazone (rosi) on gene expression. Rosi induction of ABCA1, which regulates cholesterol met…
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个。
【主题与分类】
主题标签：GPL11154、9606。
【适用方向】
组学数据适用于生物标志物发现与分子分型相关建模研究。
【获取与许可】
源站页面：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE115421
【使用注意】
· 源站最后修改于 Nov 20 202，引用时请注意版本时效。
下载信息
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源站：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE115421
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- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据加载示例（表格/文本类）
import pandas as pd, glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))
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