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创建/更新时间

2026-10-25

资源简介

二甲双胍诱导的健康个体外周血细胞转录组变化

【一句话概览】

该研究对25名健康志愿者在二甲双胍干预前、首剂后10小时及7天疗程后采集静脉血，行RNA-Seq全血转录组分析。结果发现四类功能相关基因存在个体特异性差异表达，涉及核糖体基因及其假基因、小核仁RNA、胰岛素产生相关基因和胆固醇稳态相关基因；校正个体表达后，多数受试者富集免疫应答相关通路。研究首次揭示二甲双胍转录调控效应存在明显个体间差异（来源 NCBI）。

【数据集背景】

本数据集源站标题为《Metformin-induced alterations in peripheral blood cell trancriptome of healthy individuals》。源站首次发布：2019-09-20。

【数据内容】

源站原始描述：Metformin is a commonly used antihyperglycaemic agent for the treatment of type 2 diabetes. Nevertheless, the exact mechanisms of action, underlying the various therapeutic effects of metformin, remain elusive. The goal of this study was to evaluate the alterations in longitudinal whole-blood transcriptome profiles of healthy individuals after a one-week metformin intervention in order to identify the novel molecular targets and further prompt the discovery of predictive biomarkers of metformin…

中文译文（机器翻译，仅供快速理解，请以原文为准）：二甲双胍是治疗2型糖尿病常用的降糖药。然而，二甲双胍各种治疗作用背后的确切作用机制仍不清楚。本研究旨在评估健康个体在接受为期一周的二甲双胍干预后纵向全血转录组谱的变化，以识别新的分子靶点，并进一步促进二甲双胍反应预测性生物标志物的发现。基于下一代测序的转录组分析揭示了四个功能相关基因簇，即使在单次给予二甲双胍后，也呈现受试者特异性的差异表达：核糖体基因及其假基因（如RNA5-8SN1、RNA5-8SN5、RNY4P10）、小核RNA（如SNORA20、SCARNA5、SNORA80E）、与胰岛素生成相关的基因（HNF1B、HNF1A、HNF4A、GCK、INS、NEUROD1、PAX4、PDX1、ABCC8、KCNJ11）以及胆固醇稳态相关基因（APOB、LDLR、PCSK9）。在考虑受试者特异性表达后，在大多数队列中观察到与免疫反应相关通路的富集，如肠道IgA

【主题与分类】

主题标签：PRJNA565158。

【适用方向】

组学数据适用于生物标志物发现与分子分型相关建模研究。

【获取与许可】

源站页面：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/sra/SRP221453

原始链接

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/sra/SRP221453

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- ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
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数据加载示例（表格/文本类）

import pandas as pd, glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
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print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))