正常葡萄糖耐量与2型糖尿病供体胰腺切片的空间转录组学数据集
该数据集是一个包含正常葡萄糖耐量与2型糖尿病供体胰腺组织切片的空间转录组学数据,其数据模态为基因表达谱及其对应的二维空间位置信息。它主要应用于研究胰腺在健康与疾病状态下的空间基因表达模式,特别是揭示2型糖尿病的分子病理机制,并为空间转录组学数据分析中高丰度基因转录本渗漏这一技术挑战提供了实测数据和校正方法参考。
创建时间2025-05-22
更新时间2025-06-26
资源简介
该数据集是一个人类胰腺组织的空间转录组学数据集,旨在研究健康与疾病状态下胰腺基因表达的空间分布特征。数据集包含来自三名正常葡萄糖耐量(NGT)供体和三名2型糖尿病(T2D)供体的胰腺组织切片,使用10x Genomics Visium平台进行空间转录组测序,获取了基因表达信息及其在组织中的精确空间位置。数据构建过程中发现并量化了高丰度基因(如INS和GCG)的转录本“渗漏”现象,并提供了基于概率模型的校正方法。该数据集主要用于研究胰腺在生理和病理状态下的空间基因调控机制,特别是2型糖尿病的分子病理基础,为空间转录组学数据分析中的技术校正提供了重要参考。
提供机构:Zenodo
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