1型和2型糖尿病心脏转录组测序原始计数数据
该数据集包含1型和2型糖尿病小鼠及对照组心脏的转录组测序原始计数数据，数据模态为基因表达矩阵，通过对小鼠心脏RNA进行Illumina平台测序、比对和计数获得，主要用于研究糖尿病心脏病变的分子机制、差异表达基因识别以及相关生物标志物的探索。
创建时间2025-12-03
更新时间2025-12-03
原始链接
https://figshare.com/articles/dataset/Type_1_and_Type_2_diabetic_hearts_transcriptional_sequencing_raw_count_data/30774812/1
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资源简介
该数据集是1型和2型糖尿病小鼠及其对应对照组心脏的转录组测序数据。通过对小鼠心脏组织进行RNA提取，在Illumina PE150平台上完成测序。原始测序读数使用Hisat2（v0.1.6-beta）以默认参数比对至Ensembl小鼠基因组参考（mm10, GRCm38），并通过HTSeq（v0.2.1）获取基因水平的原始计数，仅保留外显子区域的读数并汇总每个基因的计数，排除了跨多个基因或多个基因组位点的读数，最终形成基因表达矩阵。该数据集可用于研究糖尿病心脏病变的分子机制、差异表达基因分析以及相关生物标志物的发现。
提供机构：Liang, Feng
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