1型和2型糖尿病心脏转录组测序原始计数数据
该数据集包含1型和2型糖尿病小鼠及对照组心脏的转录组测序原始计数数据，数据模态为基因表达矩阵，通过对小鼠心脏RNA进行Illumina平台测序、比对和计数获得，主要用于研究糖尿病心脏病变的分子机制、差异表达基因识别以及相关生物标志物的探索。
基本信息
资源简介
1型和2型糖尿病心脏转录组测序原始计数数据
【数据集背景】
本数据集源站标题为《Type 1 and Type 2 diabetic hearts transcriptional sequencing raw count data》，为 Type 1 and Type 2 diabetic hearts transcriptional sequencing raw count data 的组成部分。源站首次发布：2025-12-03。
【数据内容】
源站原始描述：Transcriptomic sequencing results for hearts from type 1 and type 2 diabetic mice and their respective control groups. After RNA extraction from the hearts, sequencing was carried out on the Illumina PE150 platform. Raw sequencing reads were aligned to the Ensembl mouse genome (mm10, GRCm38) using Hisat2 (v0.1.6-beta) with default settings. Gene-level read counts were obtained with HTSeq (v2.0.1), retaining only reads mapping to exonic regions and summing counts per gene. Reads overlapping multi…
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个，合计 9.42 MB。数据集 DOI：10.6084/m9.figshare.30774812.v1。
【主题与分类】
源站学科分类：Genomics and transcriptomics。主题标签：Type 1 diabetes、type 2 diabetes。
【适用方向】
源站学科分类标注为 Genomics and transcriptomics。
【获取与许可】
源站页面：https://figshare.com/articles/dataset/Type_1_and_Type_2_diabetic_hearts_transcriptional_sequencing_raw_count_data/30774812
使用许可：CC BY 4.0（https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/）。
规范引用：Liang, Feng (2025). Type 1 and Type 2 diabetic hearts transcriptional sequencing raw count data. figshare. Dataset
下载信息
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使用方式
数据集获取（Figshare）
按页面 Download 按钮获取。
数据说明
该数据集是1型和2型糖尿病小鼠及其对应对照组心脏的转录组测序数据。通过对小鼠心脏组织进行RNA提取，在Illumina PE150平台上完成测序。原始测序读数使用Hisat2（v0.1.6-beta）以默认参数比对至Ensembl小鼠基因组参考（mm10, GRCm38），并通过HTSeq（v0.2.1）获取基因水平的原始计数，仅保留外显子区域的读数并汇总每个基因的计数，排除了跨多个基因或多个基因组位点的读数，最终形成基因表达矩阵。该数据集可用于研究糖尿病心脏病变的分子机制、差异表达基因分析以及相关生物标志物的发现。
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