IDR0018-Neff组织病理学(实验A)

Image Data Resource 将其介绍为一项经策展的细胞/组织成像研究,并带有 OME/EMBL-EBI 相关标注

idr
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医学影像图像分割组织切片显微成像免疫荧光内分泌疾病胰岛组织型糖尿病图像分析细胞分割
IDR idr0018-neff-histopathology (experimentA)

基本信息

模态
医学影像
任务类型
图像分割
创建/更新时间
2026-10-01

资源简介

IDR0018-Neff组织病理学(实验A)

IDR idr0018-neff-histopathology (experimentA) 是 Image Data Resource 中一项经策展的细胞/组织成像研究,对应实验 experimentA,包含 248 幅图像;在本站被归入内分泌系统疾病 / 1型糖尿病类别,来源站为 idr.openmicroscopy.org。

【数据集背景】

该数据集以 IDR idr0018-neff-histopathology 为标识,所属实验为 experimentA。Image Data Resource 将其介绍为一项经策展的细胞/组织成像研究,并带有 OME/EMBL-EBI 相关标注。在本站分类中,它与内分泌系统疾病、1型糖尿病相关。至于该研究为何归入这一疾病类别、研究假设、实验目的、样本背景、疾病模型、临床信息等,源站未提供。因此目前只能确认其作为 IDR 中一个细胞/组织成像研究的存在,以及实验归属与图像数量的基本信息,无法进一步判断其生物学背景或研究结论。

【数据内容】

该数据集包含 248 幅图像,属于 experimentA。根据来源站介绍,这些图像属于经策展的细胞/组织成像研究。除此之外,图像的具体内容、成像模态、染色方式、分辨率、像素尺寸、通道数量、视野范围、切片或样本数量、时间序列信息、标注信息、配套元数据等,源站未提供。因此,数据内容层面可确认的核心信息是图像数量和实验归属,其他细节需回到源站页面查看。

【采集与来源】

数据来源站为 idr.openmicroscopy.org。来源站将其呈现为 IDR study idr0018-neff-histopathology,实验为 experimentA,图像数为 248,并说明其为 Image Data Resource 中经策展的细胞/组织成像研究,带有 OME/EMBL-EBI 标识。关于采集机构、研究者、仪器设备、成像参数、样本制备、染色流程、伦理审批、原始数据出处等,源站未提供。

【适用场景】

通用而言,此类资源可用于浏览和检索细胞/组织成像数据。在本站分类下,该数据集可作为与内分泌系统疾病、1型糖尿病相关的影像数据入口,用于了解 IDR 中 idr0018-neff-histopathology experimentA 的数据组织方式。但具体科研用途、分析任务、疾病机制研究、诊断或治疗应用等,源站未提供,不应从现有信息中外推。

【使用方法】

使用该数据集需前往 idr.openmicroscopy.org,在 Image Data Resource 中检索 IDR idr0018-neff-histopathology 或 experimentA。关于访问权限、下载方式、文件格式、API 接口、可视化工具、数据子集选择方法等,源站未提供。因此无法给出更具体的操作步骤,实际使用应以来源站页面说明为准。

【质量与限制】

来源站称其为经策展的细胞/组织成像研究,表明其经过一定程度的整理与组织;但具体策展标准、质量控制流程、图像完整性、元数据完备性、潜在偏倚、分类准确性等,源站未提供。本站将其归入内分泌系统疾病 / 1型糖尿病,但该分类与图像实际内容的对应程度、疾病相关性证据等,源站未提供。图像数量为 248 幅,这是目前可确认的量化信息。

【引用与许可】

该数据集的许可条款、引用格式、DOI、版本信息、作者列表、致谢要求、商业使用限制等,源站未提供。若需引用或使用,应直接查阅 idr.openmicroscopy.org 上关于 IDR idr0018-neff-histopathology (experimentA) 的页面说明。在许可和引用信息不明确的情况下,不应默认其可自由使用或再分发。

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源站:https://idr.openmicroscopy.org/webclient?show=project-101

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  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
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    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

IDR 研究 idr0018-neff-histopathology。实验:experimentA。图像:248 幅。Image Data Resource:经过整理的细胞/组织成像研究(OME/EMBL-EBI)。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

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