构建竞争性内源RNA网络以发现嗜铬细胞瘤潜在长链非编码RNA生物标志物的补充材料
该数据集包含来自TCGA的嗜铬细胞瘤样本的基因表达数据,涉及RNA模态(包括lncRNA、mRNA和miRNA),通过构建竞争性内源RNA网络,分析了差异表达的RNA及其功能富集,旨在发现与患者预后相关的长链非编码RNA生物标志物,主要应用于肿瘤机制研究和生物信息学分析领域。
https://karger.figshare.com/articles/Supplementary_Material_for_Building_a_Competing_Endogenous_RNA_Network_to_Find_Potential_Long_Non-Coding_RNA_Biomarkers_for_Pheochromocytoma/7477823
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资源简介
该数据集是一个针对嗜铬细胞瘤(PCC)的竞争性内源RNA(ceRNA)网络研究的补充材料。数据来源于癌症基因组图谱(TCGA)数据库,包含183例PCC样本和3例对照样本。通过edgeR软件包分析差异表达的RNA,包括554个差异表达的长链非编码RNA(lncRNA)、1775个mRNA和40个miRNA,并利用DAVID数据库进行功能富集分析,通过Cytoscape构建了lncRNA/mRNA/miRNA ceRNA网络。研究最终识别出23个lncRNA、22个mRNA和6个miRNA构成的网络,并发现其中两个lncRNA(C9orf147和BSN-AS2)与患者总生存期显著相关,可作为潜在的预后生物标志物和治疗靶点。该数据集主要应用于肿瘤研究、基因表达分析和生物信息学领域,旨在探索PCC的发病机制及lncRNA在ceRNA网络中的预后价值。
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