PXD000162：缺氧诱导的人前脂肪细胞与脂肪细胞分泌组变化

数据集获取

源站：https://ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD000162

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数据说明

白色脂肪组织（WAT）通过分泌具有内分泌和旁分泌作用的蛋白质参与能量代谢。肥胖相关的增大WAT分泌模式的失调可能导致肥胖相关疾病。这种失调可能是由血管化不良的WAT引起的缺氧状态所致。缺氧对人（前）脂肪细胞分泌组的影响很大程度上尚不清楚。因此，通过使用2DE结合生物信息学分析，研究了经CoCl2处理和未经处理的人SGBS（前）脂肪细胞的分泌组变化。此外，通过蛋白质周转实验分析了蛋白质分泌的调节。缺氧诱导的分泌组变化主要与蛋白质下调和细胞外基质蛋白失调有关。在脂肪细胞中观察到的胶原蛋白上调可能对细胞存活至关重要，而前脂肪细胞中胶原蛋白的下调可能表明分化过程受到干扰。这些缺氧诱导的变化可被视为WAT功能障碍，可能导致肥胖相关并发症。

此外，从脂肪细胞分泌蛋白中鉴定出9种新蛋白，其中6种受缺氧调控。LC ESI-MS/MS与数据库检索：切取的凝胶斑点经胶内胰蛋白酶消化后，取10微升消化产物在LCQ Classic（ThermoFinnigan，San Jose，CA）上进行LC ESI-MS/MS分析。捕获的样品在分析柱（Biosphere C18，粒径5 µm，柱长200 mm × 内径0.05 mm；Nanoseparations，Nieuwkoop，The Netherlands）上分离，采用含100 mM乙酸的乙腈/水溶液从5%至60%（v/v）的线性梯度，55分钟内完成（100 nL/min）。分析柱洗脱液通过Teflon连接的金涂层熔融石英发射器（内径5 µm；NanoSeparations）进行纳喷雾。对于LC-ESI-MS/MS，从Proteome Discover 1.2软件（Thermo Scientific）中选择LCQ Xcalibur v2.0 SR2原始文件和谱图，设置如下：最小峰计数50；总强度

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。