蛋白酪氨酸磷酸酶受体κ调控肥胖中糖酵解与新生脂肪生成并促进肝细胞代谢重编程
蛋白酪氨酸磷酸酶受体κ调控肥胖中的糖酵解与新生脂肪生成并促进肝细胞代谢重编程。主题标签：肥胖症、内分泌与代谢疾病、蛋白酪氨酸磷酸酶受体κ、糖酵解、新生脂肪生成、肝细胞代谢重编程
基本信息
资源简介
蛋白酪氨酸磷酸酶受体κ调控肥胖中糖酵解与新生脂肪生成并促进肝细胞代谢重编程
该数据集围绕蛋白酪氨酸磷酸酶受体κ（PTPRK）在肥胖状态下的功能展开，聚焦其对糖酵解、新生脂肪生成以及肝细胞代谢重编程的调控作用，属于内分泌、营养和代谢疾病领域中肥胖症研究方向的数据资源。数据集收录于EBI（ebi.ac.uk）平台，由Thibaut Vignane于2026年提交，主题标签涵盖肥胖症、内分泌与代谢疾病、蛋白酪氨酸磷酸酶受体κ、糖酵解、新生脂肪生成和肝细胞代谢重编程。整体而言，该数据集为研究肥胖相关肝脏代谢改变及磷酸酶调控机制提供了可参考的数据基础，适用于代谢生物学、肝脏生理学及肥胖病理机制等方向的探索性分析。
【数据集背景】
肥胖症是内分泌与营养代谢疾病领域的重要公共卫生问题，其发生发展涉及肝脏等多个器官的代谢适应与重编程。在肥胖状态下，肝细胞的糖代谢与脂质代谢通路往往发生显著改变，糖酵解增强与新生脂肪生成增加是其中受到关注的代谢特征。蛋白酪氨酸磷酸酶受体κ作为一种受体型磷酸酶，在该数据集中被置于调控上述代谢过程的中心位置。数据集旨在支撑对蛋白酪氨酸磷酸酶受体κ如何调控糖酵解、新生脂肪生成并促进肝细胞代谢重编程这一科学问题的研究，其背景定位于肥胖相关的肝脏代谢紊乱机制探索。
【数据内容】
该数据集的主题内容围绕蛋白酪氨酸磷酸酶受体κ对糖酵解和新生脂肪生成的调控作用，以及其在肥胖背景下促进肝细胞代谢重编程的过程。数据所覆盖的主题标签包括肥胖症、内分泌与代谢疾病、蛋白酪氨酸磷酸酶受体κ、糖酵解、新生脂肪生成、肝细胞代谢重编程。关于具体的样本类型、实验条件、数据文件格式、数据量规模及所含组学层面等细节，源站未提供。
【采集与来源】
该数据集来源于EBI（ebi.ac.uk）平台，源站描述中给出的引用信息为：Thibaut Vignane (2026). Protein tyrosine phosphatase receptor kappa regulates glycolysis, de novo lipogenesis and promotes hepatocyte metabolic reprogramming in obesity. [Dataset]. https://www.ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD046506。数据集的具体采集方法、实验设计、样本来源与处理流程等，源站未提供。
【适用场景】
基于其主题定位，该数据集可适用于肥胖症相关肝脏代谢机制的研究场景，例如探讨蛋白酪氨酸磷酸酶受体κ在糖酵解与新生脂肪生成调控中的作用，分析肝细胞代谢重编程在肥胖状态下的表现，以及作为内分泌与营养代谢疾病方向中代谢通路研究的参考数据。具体适用的分析类型与实验场景，源站未提供。
【使用方法】
该数据集可通过EBI平台的项目页面（https://www.ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD046506）获取。关于数据下载方式、文件组织说明、预处理步骤及推荐的分析流程，源站未提供。
【质量与限制】
该数据集经EBI平台收录并附有明确的来源引用信息。关于数据质量评估指标、数据完整性、批次效应、样本量及潜在技术偏差等具体信息，源站未提供。使用者在开展分析时应结合自身研究目的对数据适用性进行判断。
【引用与许可】
引用该数据集时，建议采用源站给出的引用格式：Thibaut Vignane (2026). Protein tyrosine phosphatase receptor kappa regulates glycolysis, de novo lipogenesis and promotes hepatocyte metabolic reprogramming in obesity. [Dataset]. https://www.ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD046506。关于该数据集的具体许可条款与使用限制，源站未提供。
下载信息
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需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD046506
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
Thibaut Vignane (2026). Protein tyrosine phosphatase receptor kappa regulates glycolysis, de novo lipogenesis and promotes hepatocyte metabolic reprogramming in obesity. [Dataset]. https://www.ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD046506
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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