phs000408:eMERGE 肥胖症全基因组关联研究

该数据集为 dbGaP 收录的 eMERGE 肥胖症全基因组关联研究(phs000408),属于病例集(Case Set),归入内分泌、营养和代谢疾病下的肥胖症方向

dbgap
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基因组分类Case Set
phs000408: eMERGE Genome-Wide Association Studies of Obesity

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-10

资源简介

phs000408:eMERGE 肥胖症全基因组关联研究

phs000408: eMERGE Genome-Wide Association Studies of Obesity 是收录于 NCBI dbGaP 的肥胖症全基因组关联研究数据集,属于病例集(Case Set)。该数据集在分类上归入内分泌、营养和代谢疾病方向下的肥胖症领域,主题标签为 Case Set。作为 eMERGE 项目相关的遗传学研究资源,它围绕肥胖症的基因组关联分析展开,旨在为研究者提供可用于肥胖遗传机制探索的病例样本数据。数据集来源于 ncbi.nlm.nih.gov,源站将其描述为 dbGaP study (Case Set),表明其以病例集合的形式组织,适合用于以肥胖表型为核心的遗传关联研究。整体而言,该数据集聚焦肥胖症这一代谢性疾病,依托 dbGaP 平台进行归档与分发,面向需要病例集遗传数据的科研用户。

【数据集背景】

该数据集属于 eMERGE 项目框架下的肥胖症全基因组关联研究,收录于 NCBI dbGaP。eMERGE 是电子病历与基因组学结合的研究网络,其相关研究通常关注如何利用临床电子健康记录与基因型数据开展大规模遗传分析。phs000408 作为其中的肥胖症研究方向,以病例集形式存在,说明其样本构成侧重于肥胖症病例。数据集被归入内分泌、营养和代谢疾病分类下的肥胖症方向,反映出其研究主题与代谢、营养及内分泌系统密切相关。源站描述为 dbGaP study (Case Set),进一步确认了其在 dbGaP 中的研究类型与样本集合性质。

【数据内容】

该数据集为 dbGaP 收录的 eMERGE 肥胖症全基因组关联研究,主题标签为 Case Set,即病例集。其内容围绕肥胖症的全基因组关联分析展开,属于病例集合形式的数据资源。关于具体的样本数量、基因型标记数目、表型字段、变异位点信息等详细内容,源站未提供。数据集分类为内分泌、营养和代谢疾病 / 肥胖症,表明其数据主题与肥胖症的遗传关联相关。除上述信息外,数据内容的具体构成、文件类型、数据规模等细节,源站未提供。

【采集与来源】

该数据集来源于 ncbi.nlm.nih.gov,即美国国家生物技术信息中心下属的 dbGaP 数据库。源站将其描述为 dbGaP study (Case Set),说明其采集与归档依托 dbGaP 平台完成。关于样本采集的具体机构、采集时间、采集地点、纳入与排除标准、伦理审批信息等,源站未提供。数据集的来源站为 ncbi.nlm.nih.gov,其作为 dbGaP 研究记录存在,属于病例集类型。除来源站与源站描述外,采集流程、样本处理、基因分型平台等具体信息,源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于肥胖症遗传关联研究相关场景,尤其是以病例集为基础的基因组关联分析。由于其为 eMERGE 肥胖症全基因组关联研究且属于病例集,可用于探索肥胖症相关的遗传变异、候选基因或通路分析等研究方向。其分类归入内分泌、营养和代谢疾病下的肥胖症,适合代谢与营养相关遗传学研究使用。关于具体的适用分析类型、统计方法、软件工具或研究设计,源站未提供。除上述基于分类与主题标签可推断的通用研究用途外,其他具体适用场景,源站未提供。

【使用方法】

该数据集收录于 NCBI dbGaP,通常需通过 dbGaP 平台进行访问与获取。关于具体的下载流程、访问权限申请步骤、数据使用协议、所需审批环节等,源站未提供。由于其为 dbGaP study (Case Set),使用者一般需遵循 dbGaP 的数据访问规范,但具体操作细节源站未提供。关于数据格式、预处理方式、分析流程、配套工具等,源站未提供。

【质量与限制】

该数据集为 dbGaP 收录的 eMERGE 肥胖症全基因组关联研究,属于病例集。关于数据质量评估指标、缺失率、质控标准、批次效应、样本重复性等具体质量信息,源站未提供。其限制方面,由于为病例集,可能不包含对照组信息,但具体样本构成与对照设置情况,源站未提供。关于数据覆盖范围、人群代表性、版本更新、已知偏差等,源站未提供。

【引用与许可】

该数据集来源于 ncbi.nlm.nih.gov,为 dbGaP 收录的研究 phs000408。关于具体的引用格式、文献出处、许可协议、使用条款、数据共享政策等,源站未提供。使用者应参考 dbGaP 平台的相关规定,但具体许可与引用要求,源站未提供。

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源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/projects/gap/cgi-bin/study.cgi?study_id=phs000408

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    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
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数据说明

dbGaP study (Case Set).

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