腹股沟脂肪组织中的miRNA表达

数据集获取

源站：https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-GEOD-74753

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

我们探究了miRNAs是否参与PRDM16蛋白表达。因此，我们采用微阵列技术，对来自对照组、禁食组及冷暴露组的C57BL/6J雄性小鼠腹股沟脂肪组织进行了分析。在此数据集中，我们纳入了从对照组、禁食组及冷暴露组小鼠解剖取得的腹股沟脂肪组织中获取的所有miRNA表达数据。通常，微小RNA（miRNAs）是一类小型非编码RNA，能在转录后水平负向调控基因表达。基于先前的结果，我们提出疑问：在不同生理刺激下，miRNAs是否参与调节ingWAT中PRDM16的表达。为此，我们利用冷暴露小鼠、禁食小鼠及对照组小鼠的ingWAT进行了miRNA微阵列分析。鉴于冷暴露增加了PRDM16蛋白水平，而禁食则降低了其表达，我们选择了表达模式与PRDM16相反的miRNAs。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。