肥胖儿童大网膜脂肪组织差异基因表达数据集

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE9624

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

表征与脂肪组织相关的基因是理解肥胖发病机制和开发该疾病治疗方法的关键。脂肪组织中的差异基因表达已在成年期被描述，但尚无针对儿童期的研究。本研究的目的是比较肥胖青春期前儿童与正常体重儿童大网膜脂肪组织中的基因表达。我们选择了5名肥胖儿童（按年龄和性别校正的BMI z评分>2）和6名正常体重儿童。从大网膜脂肪组织活检中提取RNA，并将cRNA杂交到人类基因组U133 Plus 2.0芯片（Affymetrix®）上。对每个样本进行微阵列实验，并在10名肥胖和10名正常体重青春期前儿童中通过实时RT-PCR确认所选组的基因表达值。发现1276个基因在P<0.05水平上存在差异表达。在这些差异基因中，201个上调（Fc>2），42个下调（Fc<-2）。儿童肥胖中涉及代谢和信号通路的基因发生了改变。关键词：疾病状态分析

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。