GSE66540:snoRNA 在代谢应激中激活 PKR 的潜在作用
该数据集来自 NCBI GEO,标题为 GSE66540,研究 snoRNA 在代谢应激下激活 PKR 的潜在作用。数据通过高通量测序分析非编码 RNA,比较棕榈酸处理与 mock 处理下 PKR_WT 样本中 snoRNA 的富集情况,属于内分泌、营养和代谢疾病/肥胖症方向

基本信息
资源简介
GSE66540:snoRNA 在代谢应激中激活 PKR 的潜在作用
A potential role for snoRNA in PKR activation during metabolic stress
该数据集来自 NCBI GEO,标题为 GSE66540,研究 snoRNA 在代谢应激下激活 PKR 的潜在作用。数据通过高通量测序分析非编码 RNA,比较棕榈酸处理与 mock 处理下 PKR_WT 样本中 snoRNA 的富集情况,属于内分泌、营养和代谢疾病/肥胖症方向。可用于探索代谢应激中 snoRNA 与 PKR 的关联及非编码 RNA 表达分析(来源 NCBI)。
【数据集背景】
源站首次发布:Mar 04 201。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):PKR(Protein Kinase RNA-activated)可被代谢应激(如与肥胖相关的应激)激活,且这种激活依赖其 RNA 结合结构域。本研究探讨内源性 RNA 是否在脂质暴露下触发 PKR 激活。结果表明,在代谢应激过程中 snoRNA(small nucleolar RNAs)与 PKR 结合。高通量测序显示,与 mock 处理样本相比,棕榈酸处理后 PKR_WT 样本中 snoRNA 富集。
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个,合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签:GPL13112、10090。本站分类:内分泌、营养和代谢疾病/肥胖症。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE66540
【使用注意】
· 源站最后修改于 May 15 201,引用时请注意版本时效。
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pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
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- OpenDataLab:
数据说明
PKR(蛋白激酶R,RNA激活型)可被代谢应激(如与肥胖相关的应激)激活,且这种激活依赖于其RNA结合结构域。本研究探讨了内源性RNA是否在脂质暴露下触发PKR激活。结果表明,在代谢应激过程中,小核仁RNA(snoRNA)与PKR结合。高通量测序显示,与模拟处理样本相比,棕榈酸处理后PKR_WT样本中snoRNA富集。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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