Ybx3敲低对C3H10T1/2前脂肪细胞棕色脂肪分化基因表达的影响

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE277858

标准获取流程：

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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
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     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

激活棕色脂肪组织(BAT)产热以增加能量消耗，是抗击肥胖和代谢紊乱的一种有前景的疗法。尽管在转录层面已有研究，但由RNA结合蛋白(RBPs)介导的BAT产热转录后调控研究仍不完整。本研究旨在鉴定和表征新型RBPs在BAT分化和功能中的生理作用。在此，我们利用多个已发表的数据集，鉴定出Y-box结合蛋白3(YBX3)是一种负责BAT分化和功能的新型RBP。YBX3是一种富含于BAT的RBP，受冷刺激和β3-肾上腺素能/cAMP信号诱导，并受热刺激抑制。体外功能缺失和功能获得实验表明，YBX3对棕色脂肪细胞分化和产热至关重要。BAT特异性敲除Ybx3会削弱产热并加剧饮食诱导的肥胖，而Ybx3过表达则促进产热并对饮食诱导的代谢功能障碍具有保护作用。

转录组分析和线粒体应激测试表明，Ybx3缺陷损害了线粒体氧化磷酸化，而这是导致产热失败的原因。在机制上，YBX3稳定Slc3a2的mRNA，促进支链氨基酸（BCAA）通量，并以PPARγ依赖的方式促进BCAA分解代谢限速酶的表达，从而为棕色脂肪细胞分化和BAT产热提供燃料。最后，BAT特异性Ybx3的增益可促进BAT产热，以抵御饮食诱导的代谢失调。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。