3T3-L1前脂肪细胞中LSD1敲低数据集
数据基于表达谱芯片平台GPL1261(小鼠10090),记录3T3-L1前脂肪细胞中组蛋白去甲基化酶LSD1敲低后的基因表达情况

基本信息
资源简介
3T3-L1前脂肪细胞中LSD1敲低数据集
LSD1 knockdown in 3T3-L1 preadipocytes
该数据集来自NCBI GEO,标题为LSD1 knockdown in 3T3-L1 preadipocytes,包含1个文件(GSE25423_series_matrix.txt.gz),属于内分泌、营养和代谢疾病/肥胖症分类。数据基于表达谱芯片平台GPL1261(小鼠10090),记录3T3-L1前脂肪细胞中组蛋白去甲基化酶LSD1敲低后的基因表达情况。源站描述指出LSD1敲低导致脂肪生成缺陷并解除炎症程序的抑制,可用于研究肥胖相关脂肪细胞分化与炎症的分子机制(来源 NCBI)。
【数据集背景】
源站首次发布:Nov 16 201。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):肥胖常伴随低度全身性炎症状态,该状态促进胰岛素抵抗和动脉粥样硬化并发症的发生。这通常与脂肪组织中巨噬细胞浸润增加以及脂肪细胞分化缺陷相耦合,后者导致以脂肪因子表达模式失调为特征的高肥大脂肪细胞积累。在此我们显示,在3T3-L1前脂肪细胞中敲低组蛋白去甲基化酶lsd1会导致脂肪生成缺陷以及这些细胞中炎症程序的去抑制。
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个,合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签:Expression profiling by array、GPL1261、10090。本站分类:内分泌、营养和代谢疾病/肥胖症。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE25423
【使用注意】
· 源站最后修改于 Feb 11 201,引用时请注意版本时效。
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- OpenDataLab:
数据说明
肥胖常与低度全身性炎症状态相关,该状态促进胰岛素抵抗和动脉粥样硬化并发症的发生。这通常伴随脂肪组织中巨噬细胞浸润增加以及脂肪细胞分化缺陷,导致以脂肪因子表达模式失调为特征的大型脂肪细胞积聚。本研究表明,在3T3-L1前脂肪细胞中敲低组蛋白去甲基化酶lsd1会导致脂肪生成缺陷,并使这些细胞中的炎症程序去抑制。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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