十四烷基硫代乙酸（TTA）对大西洋鲑巨噬细胞样细胞的抗炎作用

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE25328

标准获取流程：

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数据说明

背景：商业大西洋鲑鱼被喂食高脂肪水平的饲料，以促进快速且经济有效的生长。为避免肥胖的负面影响，能够刺激脂肪代谢和免疫功能的食品添加剂备受关注。TTA，即十四烷基硫代乙酸，是一种合成脂肪酸，最可能通过激活过氧化物酶体增殖物激活受体（PPARs）来刺激线粒体β-氧化。PPARs是重要的转录因子，调控包括脂肪代谢和免疫反应在内的多种功能。大西洋鲑鱼实验表明，补充TTA的饲料在病毒性疾病自然爆发期间显著降低了死亡率，提示免疫系统具有调节作用。结果：为了深入了解TTA对大西洋鲑鱼免疫系统的影响，使用44K寡核苷酸鲑鱼微阵列SIQ2.0和大西洋鲑鱼巨噬细胞样细胞系ASK进行了析因高通量微阵列实验。该实验用于确定TTA的转录效应、TTA在poly(I:C)诱导细胞中的效应以及用TTA预处理细胞的效应。

表达模式显示，由TTA调控的很大一部分基因与脂质代谢及线粒体β-氧化增强相关。此外，我们发现对于一部分基因，TTA拮抗了poly(I:C)的转录效应。这一点，连同qRT-PCR结果显示TTA增加了抗炎性IL10的转录，表明其具有抗炎效应。结论：我们证明TTA对经人工dsRNA poly(I:C)刺激的巨噬细胞样鲑鱼细胞具有显著影响。TTA在巨噬细胞中的免疫刺激效应涉及脂质代谢增强和炎症状态抑制。因此，这表明TTA引导巨噬细胞样细胞向替代性、抗炎性活化方向极化。这对TTA作为饲料添加剂具有积极意义。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。