人类睾丸衰老单细胞分析及与体重指数升高的相关性

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE182786

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

老年男性的生殖健康水平下降，然而人们对睾丸衰老在分子和基因组层面的认识仍十分有限。本研究利用单细胞RNA测序技术，对来自年轻男性和老年男性（>60岁）的44,000余个细胞进行了图谱分析，并考察了生殖系发育及体细胞微环境中的年龄相关变化。有趣的是，精原干细胞的年龄相关变化似乎较为轻微，而精子发生及体细胞微环境的年龄相关失调则从中度到重度不等。发生改变的信号通路包括多种细胞类型中的信号传导与炎症、支持细胞中的代谢信号、间质细胞中的hedgehog信号与睾酮生成、睾丸管周细胞中的细胞死亡与生长，以及间质细胞和管周细胞中可能的发育退化。值得注意的是，失调的程度与老年男性的体重指数相关，而在年轻男性中则无此关联。综上所述，我们揭示了衰老所致睾丸复杂变化的候选分子机制，以及肥胖等并发慢性疾病对这些变化的加剧作用。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。