儿童肥胖与正常体重肌肉组织表达数据
该数据集来自 NCBI GEO,包含儿童肥胖与正常体重个体股直肌样本的表达谱芯片数据,使用 GPL570 平台,物种为人类(9606)

基本信息
资源简介
儿童肥胖与正常体重肌肉组织表达数据
GSE139400 是一个来自 NCBI GEO 的基因表达数据集,主题为儿童肥胖与正常体重个体肌肉组织的表达谱分析。该数据集聚焦于内分泌、营养和代谢疾病领域中的肥胖症,采用表达谱芯片技术,平台为 GPL570,物种为人类(9606)。数据集包含 1 个文件,样例文件名为 GSE139400_series_matrix.txt.gz,作者为 Concepcion,Aguilera Garcia,发布时间为 Oct 25 201。整体而言,该数据集为研究儿童肥胖相关的肌肉组织分子特征提供了可公开获取的表达数据资源。
【数据集背景】
该数据集来源于 NCBI GEO,源站标题为“Expression data from muscle tissue in children with obesity and normal weight”。源站描述指出,该分析针对肥胖儿童与正常体重儿童的股直肌样本。肥胖儿童相比正常体重儿童,以更高比例表现出胰岛素抵抗(IR)及其他代谢异常。该研究结果旨在为儿童肥胖发病机制背后的分子机制提供见解。数据集所属分类为内分泌、营养和代谢疾病 / 肥胖症,主题标签包括 Expression profiling by array、GPL570 和 9606。
【数据内容】
该数据集包含 1 个文件,样例文件为 GSE139400_series_matrix.txt.gz。数据内容为儿童肥胖与正常体重个体股直肌样本的表达谱芯片数据,使用 GPL570 平台,物种为人类(9606)。数据以 GZIP 压缩包形式提供。除上述信息外,源站未提供关于样本数量、分组细节、基因数量或具体表达矩阵字段的更多说明。
【采集与来源】
数据采集自 NCBI GEO,源站为 ncbi.nlm.nih.gov。样本类型为儿童股直肌组织,比较对象为肥胖儿童与正常体重儿童。作者为 Concepcion,Aguilera Garcia,发布时间为 Oct 25 201。关于样本采集地点、伦理审批、临床指标测量方法等细节,源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于研究儿童肥胖相关的肌肉组织基因表达变化,可用于探索肥胖儿童与正常体重儿童在股直肌表达谱上的差异,并为理解胰岛素抵抗及其他代谢异常的分子机制提供数据基础。由于使用 GPL570 平台且物种为人类,适合与同类平台或相同物种的表达谱数据进行比较分析。具体分析场景需结合源站描述和数据本身确定,源站未提供更详细的适用建议。
【使用方法】
使用时可下载数据文件 GSE139400_series_matrix.txt.gz,按 GZIP 压缩包格式读取。建议先在小样本上核对字段与编码,确认无误后再批量接入。关于芯片注释、归一化方法或分析流程的细节,源站未提供。
【质量与限制】
该数据集仅包含 1 个文件,源站未提供样本量、重复数、质控指标或批次信息,因此无法依据现有信息评估数据质量。数据仅覆盖股直肌组织,结论不宜直接推广至其他组织。源站描述提及肥胖儿童胰岛素抵抗及其他代谢异常的发生率较高,但未提供具体统计指标。其他限制源站未提供。
【引用与许可】
作者为 Concepcion,Aguilera Garcia,发布时间为 Oct 25 201。关于引用方式、许可协议或使用限制,源站未提供。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE139400
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
对肥胖儿童和正常体重儿童股直肌样本的分析。肥胖儿童出现胰岛素抵抗(IR)及其他代谢异常的比例高于正常体重儿童。研究结果有助于深入了解儿童肥胖发病机制的分子机制。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
数据缺失?
依托陕西、四川两大基地,我们与超过十家三甲医院建立直接合作关系,覆盖合规授权、采集治理、专业标注、数据交付的全流程,为AI医疗团队提供即拿即用的高质量临床数据。
⚡️ 需要数据支持或标注服务?立即联系我们获取专业方案。




