Men1基因敲除小鼠全外显子组测序数据
该数据集包含Men1基因敲除小鼠模型的全外显子组测序数据，涵盖肿瘤组织、瘤旁正常组织及对照正常肺组织的基因组序列信息，数据模态为基因测序数据。其主要用途是研究多发性内分泌腺瘤病1型的肿瘤发生机制，通过分析体细胞突变、拷贝数变异和突变特征，为肿瘤基因组学和疾病模型构建提供关键数据支持。
创建时间2025-07-16
更新时间2025-09-01
原始链接
https://www.scidb.cn/detail?dataSetId=072deea5c65e4b208f1bc8f51997dae1
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资源简介
该数据集包含Men1基因敲除小鼠模型的全外显子组测序数据。数据来源于通过他莫昔芬诱导的Men1f/f;UBC-Cre小鼠，在诱导后12个月采集的肿瘤组织、瘤旁正常组织以及对照小鼠的正常肺组织。测序由诺禾致源（北京）完成，采用Covaris M220剪切、Agilent SureSelect Human All Exon V5/V6建库、RNA探针杂交捕获以及Illumina HiSeq平台测序。生物信息分析流程包括BWA比对、Sambamba去重复、SAMtools检测SNP/INDEL、muTect/Strelka检测体细胞突变、control-FREEC分析拷贝数变异、ANNOVAR注释以及MuSic进行突变特征和通路富集分析。该数据集主要用于研究多发性内分泌腺瘤病1型（MEN1）的肿瘤发生机制、体细胞突变谱和基因组变异特征，适用于肿瘤基因组学、基因功能与疾病模型等领域。
提供机构：Aobo Lian; Guanghui Jing
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