GEO GSE198555 恶性肿瘤高钙血症模型单细胞转录组数据集
用于研究恶性肿瘤引起高钙血症病理机制的单细胞数据集
基本信息
资源简介
GEO GSE198555 恶性肿瘤高钙血症模型单细胞转录组数据集
【数据集背景】
本数据集源站标题为《Overdominant expression of related genes of ion homeostasis improves K+ content advantage in hybrid tobacco leaves》。源站首次发布：Mar 14 202。
【数据内容】
源站原始描述：Through a two-year field experiment, G70×GDH11 with strong heterosis and K326×GDH11 with weak heterosis were screened out. Transcriptome analyses revealed that 80.89% and 57.28% of the differentially expressed genes (DEGs) in the strong and weak heterosis combinations exhibited an overdominant expression pattern, respectively. The genes that up-regulated the overdominant expression in the strong heterosis hybrids were significantly enriched in the ion homeostasis. Genes involved in K+ transport…
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个。
【主题与分类】
主题标签：Expression profiling by high throughput sequencing、GPL29390、4097。
【适用方向】
文本类数据可用于医学自然语言处理，如命名实体识别、信息抽取与文本分类。
【获取与许可】
源站页面：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE198555
【使用注意】
· 源站最后修改于 Jul 20 202，引用时请注意版本时效。
下载信息
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使用方式
数据集获取
源站：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE198555
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据集大小约 1.20 GB。
数据说明
恶性肿瘤高钙血症（HHM）是高钙血症的重要临床类型。该数据集包含肿瘤分泌甲状旁腺素相关肽（PTHrP）引发高钙血症模型的单细胞转录组学测序数据，用于研究高钙血症状态下，外周血免疫细胞及骨髓微环境的转录谱变化和病理机制。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
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