高胆固醇高脂饮食对狒狒遗传调控影响的数据集

该数据集包含从99只狒狒的三种组织中获取的基因表达数据,属于基因组学模态,主要研究高胆固醇高脂饮食干预下基因-环境互作对表达数量性状位点的影响,旨在揭示饮食响应性遗传调控机制,并用于解释人类代谢疾病的全基因组关联研究信号,为代谢疾病的动物模型研究提供支持。

The University of ChicagoThe University of Chicago
Zenodo
2023-11-20 更新
浏览 27
饮食干预遗传调控代谢疾病动物模型
Genetic regulatory effects in response to a high cholesterol, high fat diet in baboons

基本信息

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0.15 GB
许可
cc-by-4.0
创建/更新时间
2023-11-20

资源简介

高胆固醇高脂饮食对狒狒遗传调控影响的数据集

【数据集背景】

本数据集源站标题为《Genetic regulatory effects in response to a high cholesterol, high fat diet in baboons》。源站首次发布:2023-08-01。

【数据内容】

源站原始描述:Disease-associated loci discovered through genome-wide association studies (GWAS) are primarily located in non-coding regions with putative regulatory effects on gene expression. Steady-state, standard expression quantitative trait loci (eQTLs) explain only a limited portion of GWAS signals, while eQTLs involved in gene-by-environment (GxE) interactions have rarely been characterized in humans due to experimental challenges. Here, we characterized gene-by-diet effects in a baboon model system. B…

【数据结构与技术规格】

文件数 3 个,合计 153.36 MB。数据集 DOI:10.5281/zenodo.10158085。

【获取与许可】

源站页面:https://zenodo.org/records/10158085

使用许可:cc-by-4.0。

【使用注意】

· 源站最后修改于 2023-11-20,引用时请注意版本时效。

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数据集获取(Zenodo 公开直链)

源站:https://zenodo.org/doi/10.5281/zenodo.10158085

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数据说明

该数据集是一个基因组学数据集,旨在研究高胆固醇、高脂饮食条件下狒狒模型中的基因-环境互作(GxE)对基因表达的调控影响。数据包含从99只圈养狒狒中采集的三种组织类型的基因表达数据,通过分析识别出数百个具有高度组织特异性的饮食响应性表达数量性状位点(eQTL)。这些eQTL在基因组定位和基因特征上与稳态eQTL存在显著差异,且其对应的人类同源基因与代谢性状的全基因组关联研究(GWAS)信号显著富集,表明环境响应性eQTL可能解释那些未与标准eQTL重叠的GWAS位点。该数据集主要用于探索遗传调控的动态复杂性,以及利用狒狒模型增强对人类复杂疾病(如代谢疾病)GWAS信号的理解。

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