基于验证性插入诱变的正向遗传筛选调控胆固醇合成数据

数据集获取

源站：https://search.dataone.org/view/null

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

该数据集来源于一项利用正向遗传学方法研究胆固醇代谢调控机制的研究。数据集包含通过验证性插入诱变（VBIM）系统筛选出的突变细胞系数据，具体涉及对25-羟胆固醇（25-HC）和SR-12813具有抗性的突变体。这些数据包括五个突变细胞系的遗传和分子特征，其中四个固醇抗性突变体涉及固醇调节元件结合蛋白（SREBP）-2的截短或SCAP蛋白的过表达，另一个SR-12813抗性突变体则与HMG-CoA还原酶的催化结构域截短相关。数据来源为实验构建的突变细胞模型，主要应用于胆固醇生物合成途径的基因调控网络解析、药物靶点发现以及代谢性疾病（如高胆固醇血症）的机制研究。

数据加载示例（表格/文本类）

import pandas as pd, glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))