WTCCC 自身免疫性甲状腺疾病病例对照研究

该数据集来自 omicsdi.org,为 WTCCC 针对自身免疫性甲状腺疾病(ATD)开展的全基因组病例对照关联研究,并以 1958 British Birth Cohort 收集样本作为对照

omicsdi
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基因组分类Genomics
WTCCC case-control study for Autoimmune Thyroid Disease

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-10

资源简介

WTCCC 自身免疫性甲状腺疾病病例对照研究

WTCCC case-control study for Autoimmune Thyroid Disease 是一个围绕自身免疫性甲状腺疾病(Autoimmune Thyroid Disease,ATD)开展的全基因组病例对照关联研究数据集,归属于内分泌、营养和代谢疾病领域下的其他类别,主题标签为 Genomics,来源站为 omicsdi.org。该研究由 WTCCC 组织实施,采用全基因组关联分析策略,将自身免疫性甲状腺疾病病例与对照样本进行系统比较,以探索与该疾病相关的遗传变异。其对照样本来自 1958 British Birth Cohort 收集,这一设计有助于在较大规模人群中评估遗传因素与 ATD 易感性之间的关联。整体而言,该数据集为研究者提供了一个聚焦自身免疫性甲状腺疾病、以病例对照为基本框架的基因组学资源,可用于相关遗传关联分析及后续验证研究。

【数据集背景】

自身免疫性甲状腺疾病是一类由免疫系统异常攻击甲状腺组织而引发的疾病,通常涉及遗传易感性与环境因素的共同作用。全基因组病例对照关联研究是识别复杂疾病遗传风险位点的重要策略之一。WTCCC 针对自身免疫性甲状腺疾病开展了此项研究,旨在通过全基因组范围的遗传标记扫描,比较病例组与对照组之间的等位基因或基因型频率差异,从而发现与疾病相关的候选区域。该数据集即来源于这一研究背景,其核心定位是服务于自身免疫性甲状腺疾病的遗传关联分析。

【数据内容】

该数据集属于全基因组病例对照关联研究数据,研究疾病为自身免疫性甲状腺疾病(ATD),主题标签为 Genomics。数据内容围绕病例与对照的基因组信息展开,用于支持全基因组关联分析。源站描述中明确其为 WTCCC genome-wide case-control association study for Autoimmune Thyroid Disease (ATD),并以 1958 British Birth Cohort collection 作为对照来源。关于具体的样本数量、遗传标记数目、基因型平台、变异位点清单、统计结果等详细内容,源站未提供。

【采集与来源】

该数据集的来源站为 omicsdi.org。研究由 WTCCC 组织,属于全基因组病例对照关联研究。对照样本来自 1958 British Birth Cohort collection,即 1958 年英国出生队列收集的样本。病例样本的具体来源、招募方式、纳入与排除标准、伦理审批信息以及样本采集流程等,源站未提供。数据所依托的原始研究项目、资助信息及具体协作单位,源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于自身免疫性甲状腺疾病遗传易感性的研究场景,尤其是全基因组关联分析、候选区域探索以及病例对照比较分析。研究者可将其用于识别与 ATD 相关的遗传变异,或作为独立数据集参与跨研究比较与荟萃分析。由于主题标签为 Genomics,其典型用途还包括基因组水平的数据挖掘与统计遗传学分析。关于该数据集是否适用于特定人群、特定亚型或临床预测建模,源站未提供明确说明。

【使用方法】

该数据集可通过来源站 omicsdi.org 获取或检索。具体的数据下载方式、文件格式、访问权限、是否需要注册或申请、配套的分析工具与流程等,源站未提供。使用者在开展分析时,应依据全基因组病例对照关联研究的一般原则进行质量控制、群体分层校正和统计检验,但该数据集自身的推荐分析流程与参数设置,源站未提供。

【质量与限制】

该数据集以 1958 British Birth Cohort collection 作为对照,其病例与对照的匹配程度、样本量、基因分型质量、缺失率、 Hardy-Weinberg 平衡检验结果等质量指标,源站未提供。研究结论的适用范围、是否经过独立验证、是否存在人群特异性限制等,源站未提供。使用者需注意,该数据集仅针对自身免疫性甲状腺疾病,不应直接外推至其他甲状腺疾病或自身免疫性疾病,除非有额外证据支持。

【引用与许可】

该数据集的引用方式、许可协议、使用条款、数据共享政策以及是否允许商业用途等信息,源站未提供。使用者在引用或再利用该数据集时,应查阅来源站 omicsdi.org 及原始研究发布方的相关规定,以确认具体的引用格式与许可条件。

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数据集获取

源站:https://omicsdi.org/dataset/ega/EGAS00000000020

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

WTCCC genome-wide case-control association study for Autoimmune Thyroid Disease (ATD) using the 1958 British Birth Cohort collection as controls.

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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