局部非甾体抗炎药缓解口腔扁平苔藓及口腔苔藓样病变疼痛数据集
源站描述涉及一项纳入 153 名受试者的研究，包括 50 例糜烂型口腔扁平苔藓、51 例网状型口腔扁平苔藓和 52 名健康对照，采用 UHPLC/Q-Orbitrap HRMS 分析 40 例糜烂型、40 例网状型和 40 名健康对照样本的代谢物，筛选差异代谢生物标志物，并通过共享代谢物筛选调控基因
基本信息
资源简介
局部非甾体抗炎药缓解口腔扁平苔藓及口腔苔藓样病变疼痛数据集
DataSheet_1_Metabolomics and Transcriptomics Analysis on Metabolic Characteristics of Oral Lichen Planus.docx
该数据集来自 frontiersin.figshare.com，包含 1 个 docx 文件，标题为 DataSheet_1_Metabolomics and Transcriptomics Analysis on Metabolic Characteristics of Oral Lichen Planus.docx。源站描述涉及一项纳入 153 名受试者的研究，包括 50 例糜烂型口腔扁平苔藓、51 例网状型口腔扁平苔藓和 52 名健康对照，采用 UHPLC/Q-Orbitrap HRMS 分析 40 例糜烂型、40 例网状型和 40 名健康对照样本的代谢物，筛选差异代谢生物标志物，并通过共享代谢物筛选调控基因进行关联分析。数据。
【数据集背景】
配套论文《Metabolomics analysis of oral mucosa reveals profile perturbation in reticular oral lichen planus》发表于 Clinica Chimica Acta（2018），DOI：10.1016/j.cca.2018.09.021。源站首次发布：2021-10-19。
【数据内容】
源站描述（机器翻译，仅供参考）：目的：采用非靶向代谢组学方法探索与糜烂型和网状型口腔扁平苔藓（OLP）相关的代谢生物标志物，并将代谢物与基因表达相关联，从代谢角度研究 OLP 的病理网络通路。方法：本研究共纳入 153 名个体，包括 50 例糜烂型口腔扁平苔藓（EOLP）患者、51 例网状型口腔扁平苔藓（ROLP）患者和 52 名健康对照（HC）。采用超高效液相色谱四极杆-Orbitrap 高分辨精确质量 spectrometry（UHPLC/Q-Orbitrap HRMS）分析 40 例 EOLP、40 例 ROLP 和 40 例 HC 样本的代谢物，筛选并鉴定差异代谢生物标志物。进一步通过 EOLP 与 ROLP 之间的共享代谢物筛选调控基因，并与
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个，合计 2.11 MB。数据集 DOI：10.3389/fonc.2021.769163.s001。
【主题与分类】
源站学科分类：Cancer、Haematological Tumours、Molecular Targets、Radiation Therapy、Oncology and Carcinogenesis not elsewhere classified、Solid Tumours。主题标签：oral lichen planus、biomarkers、metabolomics、transcriptomics、pathogenesis。本站分类：内分泌、营养和代谢疾病。
【适用方向】
源站学科分类标注为 Cancer、Haematological Tumours、Molecular Targets、Radiation Therapy、Oncology and Carcinogenesis not elsewhere classified、Solid Tumours。
【获取与许可】
源站页面：https://frontiersin.figshare.com/articles/dataset/DataSheet_1_Metabolomics_and_Transcriptomics_Analysis_on_Metabolic_Characteristics_of_Oral_Lichen_Planus_docx/16830457
使用许可：CC BY 4.0（https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/）。
规范引用：Xin, Ming-zhe; Shi, Ying-ying; Li, Chun-shen; Zuo, Li-hua; Li, Na; Liu, Li-wei; et al. (2021). DataSheet_1_Metabolomics and Transcriptomics Analysis on Metabolic Characteristics of Oral Lichen Planus.docx. Frontiers. Dataset
【使用注意】
· 源站最后修改于 2023-06-08，引用时请注意版本时效。
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数据集获取（Figshare）
- 源站标题：DataSheet_1_Metabolomics and Transcriptomics Analysis on Metabolic Characteristics of Oral Lichen Planus.docx
- DOI：10.3389/fonc.2021.769163.s001
- 发布日期：2021-10-19
- 文件数：1 个
- 文件总体积：2.11 MB
- 源站页面：https://frontiersin.figshare.com/articles/dataset/DataSheet_1_Metabolomics_and_Transcriptomics_Analysis_on_Metabolic_Characteristics_of_Oral_Lichen_Planus_docx/16830457
命令行下载
curl -L -o "DataSheet_1_Metabolomics and Transcriptomics Analysis on Metabolic Characteristics of Oral Lichen Planus.docx" "https://ndownloader.figshare.com/files/31122949"
文件清单
DataSheet_1_Metabolomics and Transcriptomics Analysis on Metabolic Characteristics of Oral Lichen Planus.docx（2.11 MB）
文件总体积 2.11 MB（源站 API 实测）。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
数据说明
目的采用非靶向代谢组学方法探索与糜烂型和网纹型口腔扁平苔藓（OLP）相关的代谢生物标志物，并将代谢物与基因表达进行关联，从代谢角度探讨OLP的病理网络通路。方法本研究共纳入153例受试者，包括糜烂型口腔扁平苔藓（EOLP）患者50例、网纹型口腔扁平苔藓（ROLP）患者51例和健康对照（HC）52例。采用超高效液相色谱-四极杆-Orbitrap高分辨质谱（UHPLC/Q-Orbitrap HRMS）对40例EOLP、40例ROLP和40例HC样本的代谢物进行分析，筛选并鉴定差异代谢生物标志物。进一步通过EOLP与ROLP之间的共享代谢物筛选调控基因，并与网络数据库中OLP相关差异基因进行交叉关联。在找到关键差异基因后构建“基因-代谢物”网络。最后在验证集中验证生物标志物的诊断效能并构建诊断模型。
结果与HC组相比，EOLP组和ROLP组分别鉴定出19种和25种差异代谢物。EOLP与ROLP之间共鉴定出14种不同的代谢物。基于这些差异代谢物构建了两个诊断模型。EOLP和ROLP共有14种差异代谢物。转录组学数据显示756个差异表达基因，最终交叉网络显示19个差异基因与12种代谢物相关。富集分析显示丙氨酸、天冬氨酸和谷氨酸代谢与OLP的发病机制密切相关。结论阐明了不同类型OLP的代谢变化，提供了OLP潜在的基因扰动信息。本研究为进一步探索OLP的致病机制提供了有力支持。
许可
CC BY 4.0
引用
学术使用请引用 DOI 10.3389/fonc.2021.769163.s001（source: https://frontiersin.figshare.com/articles/dataset/DataSheet_1_Metabolomics_and_Transcriptomics_Analysis_on_Metabolic_Characteristics_of_Oral_Lichen_Planus_docx/16830457）。
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