斑马鱼胚胎亚致死暴露于全氟辛酸（PFOA）的转录组响应：96小时RNA-seq研究
该数据集来自omicsdi.org，包含斑马鱼胚胎在96小时内暴露于亚致死浓度全氟辛酸（PFOA）后的RNA测序数据，用于评估基因表达的浓度依赖性变化
基本信息
资源简介
斑马鱼胚胎亚致死暴露于全氟辛酸（PFOA）的转录组响应：96小时RNA-seq研究
该数据集题为“Transcriptomic responses of zebrafish embryos to sublethal exposure to perfluorooctanoic acid (PFOA): A 96-Hour RNA-seq Study”，来源于omicsdi.org，归类于内分泌、营养和代谢疾病 / 其他类别，主题标签为转录组学。数据集收录了斑马鱼胚胎在96小时内暴露于亚致死浓度全氟辛酸（PFOA）后所获得的RNA测序数据，旨在评估基因表达的浓度依赖性变化。全氟和多氟烷基物质（PFAS）是环境中广泛检出的持久性合成化学品，与发育毒性、内分泌干扰和肝毒性等不良效应相关。该数据集通过转录组学手段捕捉敏感转录响应及受影响的生物学通路，为PFAS的机制研究和符合伦理的危害评估提供数据支持。
【数据集背景】
全氟和多氟烷基物质（PFAS）是一类持久性合成化学品，在环境中被广泛检出，并与发育毒性、内分泌干扰和肝毒性等不良健康效应相关联。传统的化学品风险评估依赖于慢性动物研究，这类研究耗费大量资源和时间，且所能提供的机制性信息有限。在此背景下，本研究采用斑马鱼胚胎模型，在96小时内暴露于亚致死浓度的PFOA，并通过RNA测序评估基因表达的浓度依赖性变化。该工作旨在识别敏感的转录响应和受影响的生物学通路，从而支持将转录组学方法用于PFAS的机制研究与符合伦理要求的危害评估。
【数据内容】
该数据集的核心内容是斑马鱼胚胎在亚致死浓度PFOA暴露96小时后产生的RNA测序数据，用于评估基因表达的浓度依赖性变化。基于这些数据，可识别对PFOA暴露敏感的转录响应以及受影响的生物学通路。数据集的主题标签为转录组学（Transcriptomics），所属分类为内分泌、营养和代谢疾病 / 其他。关于样本数量、测序平台、读长、重复设置、具体暴露浓度梯度及数据文件格式等细节，源站未提供。
【采集与来源】
数据集来源于omicsdi.org。据源站描述，研究设计为将斑马鱼胚胎暴露于亚致死浓度的PFOA，暴露持续96小时，随后进行RNA测序以评估基因表达的浓度依赖性变化。关于具体的实验机构、采样地点、暴露体系与测序服务提供方等信息，源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于以下方向：识别斑马鱼胚胎对PFOA暴露的敏感转录响应；分析受PFOA影响的生物学通路；评估基因表达变化的浓度依赖性特征；支持PFAS毒性机制研究；以及为基于转录组学的、符合伦理要求的化学品危害评估方法提供数据参考。数据集与发育毒性、内分泌干扰和肝毒性等PFAS相关不良效应研究具有关联。关于其他具体应用场景，源站未提供。
【使用方法】
该数据集为RNA测序数据，可用于基因表达层面的转录组分析，例如比较不同暴露浓度下的基因表达变化、识别差异表达基因以及开展通路层面的分析。关于数据下载方式、文件组织格式、预处理流程、参考基因组版本及分析工具建议等，源站未提供。
【质量与限制】
该数据集基于斑马鱼胚胎96小时亚致死浓度PFOA暴露的RNA测序研究，其设计定位于转录组层面的浓度依赖性响应评估，而非慢性动物实验。源站描述指出，传统慢性动物研究资源与时间消耗大且机制信息有限，转录组学方法可提供机制性补充。关于数据质量指标（如测序深度、重复一致性、质控结果）、样本量、浓度设置范围及数据完整性等具体信息，源站未提供。
【引用与许可】
关于该数据集的引用方式、文献出处、DOI、许可协议及使用限制等信息，源站未提供。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-MTAB-15671
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
全氟和多氟烷基物质（PFAS）是一类持久性合成化学品，在环境中被广泛检出，并与发育毒性、内分泌干扰和肝毒性等不良效应相关。传统化学风险评估依赖于慢性动物研究，此类研究耗费大量资源和时间，且提供的机制性信息有限。本研究将斑马鱼胚胎暴露于亚致死浓度的PFOA中96小时，并进行RNA测序以评估基因表达的浓度依赖性变化。该数据集可用于识别敏感的转录反应及受影响的生物学通路，支持采用转录组学方法对PFAS进行机制性且符合伦理的危害评估。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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