人无血清纤维细胞、含血清纤维细胞、CD14++CD16-单核细胞、CD14++CD16+单核细胞、CD14+CD16++单核细胞和巨噬细胞的转录谱分析

数据集获取

源站：https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-MEXP-2811

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

无血清纤维细胞、含血清纤维细胞、CD14++CD16-单核细胞、CD14++CD16+单核细胞、CD14+CD16++单核细胞、巨噬细胞均源自3个独立供体，每个供体最多3个生物学重复。提取RNA（Ambion RNAqueous），用cy3标记，与cy5标记的人类参考RNA（Stratagene）混合，然后与印有Human AROS v4.0寡核苷酸（Operon）的玻片杂交。使用Perkin Elmer GX plus扫描玻片，随后用GEPAS v4.0对数据进行归一化并整理。最终数据分析使用TMEV 4.0进行。SAM分析采用0.1%错误发现率。基于此列表绘制PCA图，并使用DAVID进行探究以确定通路富集。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。