腹主动脉瘤跨物种转录组投影的可重复分析档案

该数据集是腹主动脉瘤跨物种转录组投影研究的可重复分析档案,包含版本化R分析脚本、评分定义与同源映射清单、衍生统计表及代码压缩包

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2026-07-26 更新
浏览 10
基因组分类Aortic aneurysm, abdominal/mortality
Reproducible analysis archive for cross-species transcriptomic projection of a combined immunometabolic stress model in abdominal aortic aneurysm

基本信息

模态
基因组
大小
0.014983548 GB
任务类型
分类
许可
CC BY 4.0
创建/更新时间
2026-07-26
版本
v1

资源简介

腹主动脉瘤跨物种转录组投影的可重复分析档案

Reproducible analysis archive for cross-species transcriptomic projection of a combined immunometabolic stress model in abdominal aortic aneurysm

该数据集是腹主动脉瘤跨物种转录组投影研究的可重复分析档案,包含版本化R分析脚本、评分定义与同源映射清单、衍生统计表及代码压缩包。研究基于急性小鼠骨髓来源巨噬细胞联合LPS暴露与胱氨酸饥饿扰动构建转录评分MPRS,映射至人类同源基因后投影到多个公开的腹主动脉瘤及相关主动脉疾病批量转录组与单细胞RNA测序数据中,可用于复现分析流程并探索免疫结构组织特征(来源 figshare,CC BY 4.0 许可)。

【数据集背景】

源站首次发布:2026-07-26。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):该仓库包含与题为“Cross-species transcriptomic projection of a combined immunometabolic stress model maps lineage-weighted immune-structural organization in abdominal aortic aneurysm”的手稿配套的可重复分析档案。该研究从急性小鼠骨髓来源巨噬细胞扰动中推导出mitoxyperilysis模型衍生的转录评分(MPRS),该扰动结合了脂多糖暴露与胱氨酸饥饿,并辅以因子交互和部分Torin可逆性的额外证据。源程序被映射到人类同源基因,并投影到多个公开可用的腹主动脉瘤及相关主动脉疾病背景的批量转录组和单细胞RNA测序数据集中。该档案包括版本化R分析脚本、评分定义与同源映射清单、衍生统计表、b

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 14.98 MB。数据集 DOI:10.6084/m9.figshare.33089240.v1。

【主题与分类】

源站学科分类:Other health sciences not elsewhere classified。主题标签:Aortic aneurysm, abdominal/mortality。本站分类:内分泌、营养和代谢疾病。

【适用方向】

源站学科分类标注为 Other health sciences not elsewhere classified。

【获取与许可】

源站页面:https://figshare.com/articles/dataset/Reproducible_analysis_archive_for_cross-species_transcriptomic_projection_of_a_combined_immunometabolic_stress_model_in_abdominal_aortic_aneurysm/33089240

使用许可:CC BY 4.0(https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/)。

规范引用:Zhao, Kaixun (2026). Reproducible analysis archive for cross-species transcriptomic projection of a combined immunometabolic stress model in abdominal aortic aneurysm. figshare. Dataset

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源站:https://doi.org/10.6084/m9.figshare.33089240

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    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据集大小约 15.0 MB。

数据说明

本仓库包含与手稿《联合免疫代谢应激模型的跨物种转录组投影映射腹主动脉瘤中谱系加权免疫结构组织》配套的可重复分析档案。该研究从急性小鼠骨髓来源巨噬细胞扰动(结合脂多糖暴露与胱氨酸饥饿)中推导出基于mitoxyperilysis模型的转录评分(MPRS),并辅以因子交互作用和部分Torin可逆性的额外证据。源程序被映射至人类直系同源基因,并投影至腹主动脉瘤及相关主动脉疾病背景下的多个公开可用的批量转录组和单细胞RNA测序数据集。该档案包括带版本号的R分析脚本、评分定义与直系同源清单、衍生统计表、批量队列投影结果、上下文模块分析、单细胞定位输出、敏感性分析、发表图件、软件会话信息、文件清单及完整性校验和。

这些材料旨在支持对相关手稿中所报告的分析和图表进行透明复现。原始测序数据未在本存储库中重新分发。原始数据仍可从各自的公共存储库获取,登录号见手稿报告。MPRS表示与实验扰动模型的转录相似性,不应被解释为在人腹主动脉瘤组织中存在mitoxyperilysis执行、膜破裂或特定调节性细胞死亡机制的证据。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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