模型鱼青鳉垂体3D图谱复制数据
该数据集为论文《模型鱼青鳉垂体3D图谱》的复制数据,包含超堆栈TIFF格式的成像文件,展示幼年和成年雌雄青鳉垂体中对应内分泌细胞标记物(含血管)的通道图像

基本信息
资源简介
模型鱼青鳉垂体3D图谱复制数据
该数据集为论文《模型鱼青鳉垂体3D图谱》的复制数据,包含超堆栈TIFF格式的成像文件,展示幼年和成年雌雄青鳉垂体中对应内分泌细胞标记物(含血管)的通道图像。数据集英文名称为“Replication Data for: 3D atlas of the pituitary gland of the model fish medaka (Oryzias latipes)”,由Royan, Muhammad Rahmad、Siddique, Khadeeja、Csucs, Gergely、Puchades, Maja. A.、Nourizadeh-Lillabadi, Rasoul、Bjaalie, Jan. G.、Henkel, Christiaan V.、Weltzien, Finn-Arne、Fontaine, Romain共同完成,机构为DataverseNO,于2021年发布。主题标签涵盖Medicine, Health and Life Sciences、pituitary、atlas、teleost、hormone、multihormonal cells、medaka,本站分类归入内分泌、营养和代谢疾病 / 其他。
【数据集背景】
青鳉(Oryzias latipes)是重要的模式鱼类。垂体是内分泌系统的核心腺体,其内部多种内分泌细胞类型在空间上的组织方式与激素分泌功能密切相关。该数据集作为论文《模型鱼青鳉垂体3D图谱》的复制数据发布,旨在为垂体三维图谱研究提供可复用的原始成像资料,支撑对鱼类垂体细胞空间分布与多激素细胞特征的分析。
【数据内容】
数据内容为超堆栈TIFF格式的成像文件,即论文的补充图件。这些图像展示与内分泌细胞标记物相对应的通道,并包含血管通道,覆盖幼年与成年、雄性及雌性青鳉的垂体。主题标签中的pituitary、atlas、teleost、hormone、multihormonal cells、medaka反映了数据围绕垂体图谱、硬骨鱼、激素及多激素细胞等主题。
【采集与来源】
数据来源于doi.org,机构为DataverseNO,发布时间为2021年。源站描述说明这些成像文件是论文的补充图件,以超堆栈TIFF文件形式呈现对应内分泌细胞标记物(含血管)的通道图像。其余采集设备、成像参数与样本处理细节源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于垂体三维图谱构建与展示、内分泌细胞标记物通道图像的空间分布观察,以及幼年与成年、雌雄个体间垂体组织结构的比较研究;也可作为硬骨鱼垂体激素细胞与多激素细胞相关研究的参考影像资料。具体分析用途需结合源站描述与论文内容确定。
【使用方法】
使用者可按超堆栈TIFF格式读取图像文件,利用支持多维TIFF的成像分析软件查看各通道,并按幼年、成年及雌雄分组进行观察与比较。关于通道命名、文件组织与读取参数等细节,源站未提供。
【质量与限制】
该数据集为论文补充图件的复制数据,其内容范围限于源站描述所列的成像文件与通道信息。数据未提供定量指标、样本量或验证结果,源站未提供相关质量评估信息。使用者应注意其作为补充图件的定位,不宜将其外推为完整的垂体图谱数据库。
【引用与许可】
引用时应使用数据集英文名称“Replication Data for: 3D atlas of the pituitary gland of the model fish medaka (Oryzias latipes)”,并列出上述作者、机构DataverseNO与发布年份2021。许可条款与使用条件源站未提供。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://doi.org/10.18710/NOGJQ2
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
这些影像文件是论文《模型鱼青鳉垂体三维图谱》的补充图。这些文件为超栈TIFF格式图像,展示了幼年及成年雄性、雌性青鳉垂体中对应内分泌细胞标志物的通道,包括血管。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
数据缺失?
依托陕西、四川两大基地,我们与超过十家三甲医院建立直接合作关系,覆盖合规授权、采集治理、专业标注、数据交付的全流程,为AI医疗团队提供即拿即用的高质量临床数据。
⚡️ 需要数据支持或标注服务?立即联系我们获取专业方案。




