PXD015727：组织浸润巨噬细胞在DNA损伤后介导基于外泌体的代谢重编程

数据集获取

源站：https://ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD015727

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

DNA损伤和代谢紊乱与疾病早发密切相关，但其潜在机制仍知之甚少。在此，我们表明，在携带ERCC1-XPF DNA修复缺陷（Er1F/-）的组织浸润性巨噬细胞中，持续性DNA损伤积累会触发高尔基体分散、内质网扩张、自噬和外泌体生成，从而导致在体内和离体条件下分泌细胞外囊泡（EVs）。巨噬细胞来源的EVs在Er1F/-动物血清中蓄积，并在DNA损伤后分泌到巨噬细胞培养基中。Er1F/- EV货物被受体细胞摄取，导致不依赖胰岛素的葡萄糖转运体水平升高、细胞葡萄糖摄取增强、细胞耗氧率升高以及小鼠对葡萄糖负荷的耐受性增强。我们发现，EV靶向细胞中的高葡萄糖通过mTOR激活触发促炎刺激。这反过来会在小鼠中形成慢性炎症和组织病理变化，并对DNA修复缺陷、早衰样综合征和衰老具有重要影响。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。