脓毒症诱导的急性和慢性肾脏疾病的蛋白质组学和磷酸化蛋白质组学
该数据集来自 omicsdi.org,聚焦脓毒症诱导的急性肾损伤(AKI)及其向慢性肾脏病(CKD)进展过程中的肾脏蛋白质组与磷酸化蛋白质组变化

基本信息
资源简介
脓毒症诱导的急性和慢性肾脏疾病的蛋白质组学和磷酸化蛋白质组学
该数据集来自 omicsdi.org,聚焦脓毒症诱导的急性肾损伤(AKI)及其向慢性肾脏病(CKD)进展过程中的肾脏蛋白质组与磷酸化蛋白质组变化。研究基于脓毒症 AKI 小鼠模型,在细菌感染后对肾脏蛋白质组和磷酸化蛋白质组进行定量评估,高置信度定量了超过 2,200 个肾脏蛋白,首次提供了肾脏蛋白质组广泛重塑的全局概览,并揭示了脓毒症肾脏中广泛的代谢与氧化还原过程。该数据可用于研究肾细胞对微生物入侵的响应机制,并有望作为系统生物学的参考数据集(来源 omicsdi.org)。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):脓毒症诱导的急性肾损伤(AKI)与肾功能快速下降相关,导致不可接受的高发病率和死亡率,以及向慢性肾脏病(CKD)的进展。我们最近开发了一种脓毒症 AKI 小鼠模型。通过定量评估细菌感染后肾脏蛋白质组和磷酸化蛋白质组的变化,我们以高置信度准确定量了超过 2,200 个肾脏蛋白,这为我们提供了肾脏蛋白质组广泛重塑的首次全局概览,并揭示了脓毒症肾脏中发生的广泛的代谢和氧化还原过程。这些数据将使我们前所未有地深入了解肾细胞如何响应微生物入侵,并很可能作为系统生物学的参考数据集。
【主题与分类】
主题标签:Proteomics、phosphoproteomics、sepsis、kidney、aki、ckd。本站分类:内分泌、营养和代谢疾病。
【获取与许可】
源站页面:https://omicsdi.org/dataset/pride/PXD017045
下载信息
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源站:https://omicsdi.org/dataset/pride/PXD017045
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- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
脓毒症诱导的急性肾损伤(AKI)与肾功能迅速下降相关,导致不可接受的高发病率和死亡率,以及向慢性肾脏病(CKD)的进展。我们最近开发了一种脓毒症AKI小鼠模型。通过定量评估细菌感染后肾脏蛋白质组和磷酸化蛋白质组的变化,我们以高置信度准确量化了超过2,200种肾脏蛋白质,这为我们提供了肾脏蛋白质组广泛重塑的首次全局概览,并揭示了脓毒症肾脏中发生的广泛的代谢和氧化还原过程。这些数据将为我们提供关于肾细胞如何响应微生物入侵的前所未有的见解,并很可能作为系统生物学的参考数据集。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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