基于蛋白质微阵列的51例APS1患者与21例健康对照自身抗体筛查数据集

数据集获取

源站：https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-MTAB-8097

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

1型自身免疫性多内分泌综合征（APS1）是一种单基因疾病，表现为多种自身免疫性疾病症状。该病由自身免疫调节因子（AIRE）基因突变引起，这种突变会影响胸腺对数千种外周组织抗原的展示，而这一过程对于建立中枢免疫耐受至关重要。本研究采用蛋白质组阵列对APS1中的自身免疫靶点进行了全面研究。按照Invitrogen的免疫应答生物标志物分析方案，使用推荐的检测试剂（Alexa Fluor® 647山羊抗人IgG A21445，Invitrogen）和封闭缓冲液（封闭缓冲液试剂盒PA055，Invitrogen），对蛋白质阵列（ProtoArray® v5.0 PAH0525020，Life Technology）进行了探测和扫描。血清以1：2000的比例稀释后与阵列孵育。使用GenePix 4000B微阵列扫描仪对阵列进行扫描，并使用GenePix® Pro微阵列软件（v6.1）进行对齐和数据采集。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。