范可尼-比克尔综合征相关血糖异常中GLUT2作用研究（NanoString miRNA表达谱）

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA816446

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

由于SLC2A2的内含子突变并未影响GLUT2的活性，我们进行了更多研究，以了解FBS中血糖异常的潜在分子机制。我们运用Nanostring miRNA panel v3b，对患者、母亲以及年龄和性别匹配、无血糖异常家族史的健康对照者进行了约800种miRNA的检测。我们注意到，患者与性别和年龄匹配的健康对照者之间的相关性高于患者与母亲之间的相关性，这表明miRNA表达谱可能更多地受到年龄和性别的影响，而非亲缘关系（补充图S5）。无监督层次聚类分析显示，患者样本中有123种miRNA特异性表达（补充表S2）。通过Ingenuity Pathway (IPA) 分析软件探究这些miRNA的功能，结果映射出118种miRNA（图10）。在此，我们报告了患者与对照组相比计数差异最大的30种miRNA（图11）。我们发现其中14种与T1DM相关：10种miRNA（miR-199a、miR-25-3p、miR-93-5p、miR-19b-3p、miR-107、miR-24-3p）。

与对照组相比，患者中miR-18a-5p、miR-125b-5p、miR-324-5p、miR-331-3p和hsa-miR-143-3p过表达；而与对照组相比，患者中有3种miRNA（miR-144-3p、let-7e-5p、hsa-miR-29a-3p）显著过表达。通过IPA功能分析软件生成了分子网络，其中包括从既往研究中推断出的分子（补充图S6）。根据研究数据集中所代表的分子数量与文献的比较，对分子网络进行了评分。网络1（评分33）包括与机体损伤和异常、骨骼和肌肉系统发育与功能以及组织形态学相关的基因和miRNA。miR-144家族整合到网络1中。网络2（评分31）包括胰岛素和其他基因

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。