慢性疾病患者纵向个人DNA甲基化组动态
该数据集来自 NCBI BioProject（ID 436956），主题为一名慢性疾病患者的纵向个人 DNA 甲基化组动态
基本信息
资源简介
慢性疾病患者纵向个人DNA甲基化组动态
该数据集在 NCBI BioProject 中的编号为 436956，英文名称为“Longitudinal Personal DNA Methylome Dynamics in a Human with a Chronic Condition”。从名称可以看出，它围绕一名患有慢性疾病的个体，开展纵向的个人 DNA 甲基化组动态研究。BioProject 是 NCBI 提供的一种项目记录形式，用于汇集与某一项研究计划相关的多种生物数据，这些数据通常来自单一机构或联合体，并为用户提供统一的入口来查找该项目产生的不同类型数据。本站将该数据集归入“内分泌、营养和代谢疾病 / 其他”分类，主题标签为“Other”。整体而言，该数据集的核心关注点在于慢性疾病背景下个体 DNA 甲基化组随时间变化的纵向特征，适合对表观遗传动态、慢性病相关分子变化以及个体化组学数据感兴趣的研究人员参考。
【数据集背景】
该数据集来源于 NCBI BioProject，编号 436956。BioProject 的定位是围绕某一项研究计划，汇集由单一组织或联合体产生的生物数据，并为用户提供查找该项目所生成多种数据类型的统一入口。该项目的标题明确指向“一名慢性疾病患者”的“纵向个人 DNA 甲基化组动态”，说明其研究背景聚焦于个体在慢性疾病状态下的 DNA 甲基化随时间变化情况。本站将其归入“内分泌、营养和代谢疾病 / 其他”分类，主题标签为“Other”。除上述信息外，关于该慢性疾病的具体病种、研究机构、研究目的等背景细节，源站未提供。
【数据内容】
从项目名称和主题标签来看，该数据集的内容涉及个人 DNA 甲基化组的纵向动态数据，研究对象为一名患有慢性疾病的个体。DNA 甲基化组通常指基因组范围内 DNA 甲基化修饰的总体分布与水平，纵向设计则意味着在多个时间点对同一名个体进行采样和检测，以观察甲基化模式随时间的变化。该 BioProject 记录本身作为项目入口，汇集了与该项目相关的多种数据类型。关于具体包含的样本数量、时间点数目、检测平台、甲基化位点数量、数据文件格式与规模等细节，源站未提供。
【采集与来源】
该数据集的来源站为 ncbi.nlm.nih.gov，记录类型为 BioProject，项目编号 436956。BioProject 记录通常由单一组织或联合体发起，用于整合某一研究计划产生的生物数据。该项目的标题表明其采集对象为一名慢性疾病患者的纵向个人 DNA 甲基化组数据。关于样本采集的具体时间跨度、采样部位、伦理审批信息、数据提交机构以及原始数据的具体来源机构等，源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于与个体纵向 DNA 甲基化组动态相关的研究场景，尤其是在慢性疾病背景下探讨表观遗传变化的应用。潜在用途包括：作为个体化表观遗传研究的参考数据，用于观察同一名个体在不同时间点的 DNA 甲基化模式变化；也可用于方法学探索，例如纵向组学数据的分析流程、时间序列甲基化数据的可视化与统计建模等。由于本站将其归入“内分泌、营养和代谢疾病 / 其他”分类，该数据集可能对内分泌、营养和代谢疾病领域的表观遗传研究具有参考价值。但具体的适用研究问题、疾病关联分析及临床意义，源站未提供。
【使用方法】
该数据集可通过 NCBI BioProject 记录（ID 436956）进行访问。BioProject 记录为用户提供查找该项目所生成的多种数据类型的统一入口，用户可据此定位与该项目相关的数据资源。关于具体的数据下载方式、文件格式、分析工具、访问权限及使用步骤，源站未提供。
【质量与限制】
该数据集为 NCBI BioProject 项目记录，其数据质量、完整性、准确性及更新情况由数据提交方和源站负责。由于项目标题明确指向“一名”慢性疾病患者，其研究设计为单个体纵向观察，样本量有限，结论的外推性可能受到限制。关于数据的具体质控指标、缺失情况、批次效应、技术偏差以及使用中的其他限制，源站未提供。
【引用与许可】
使用该数据集时，应引用 NCBI BioProject 记录（ID 436956）及其相关项目信息。关于该数据集的具体引用格式、许可条款、使用限制及数据共享政策，源站未提供。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA436956
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
表观基因组学调控基因表达，在精准个人健康中与基因组学同等重要，因为它深受环境和生活方式的影响。我们对一名人类志愿者在36个月内采集的外周血单个核细胞进行了全基因组DNA甲基化和相应转录组分析，生成了28个甲基化组和57个转录组数据集。我们发现，DNA甲基化组变化与偶发的血糖水平改变相关，而转录组在病毒感染等事件期间发生动态变化。大多数DNA元甲基化组变化发生在临床可检测的血糖升高前80-90天。对深度个人甲基化组数据集的分析揭示了数量空前的等位基因差异甲基化区域（aDMR），这些区域在纵向上保持稳定，并优先与等位基因特异性基因调控相关。我们的结果揭示，不同类型的“组学”数据与该个体状况的不同方面相关：DNA甲基化与慢性疾病相关，转录组与急性事件相关。总体设计：全基因组亚硫酸氢盐测序和RNA测序。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
数据缺失？
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