基本信息

模态

基因组

任务类型

预测

创建/更新时间

2026-10-21

资源简介

PRJNA1450086：Semaglutide 在 HIV 相关脂肪肥厚随机试验中减缓表观遗传衰老

该数据集来自 NCBI，英文名称为 PRJNA1450086: Semaglutide Slows Epigenetic Aging in a Randomized Trial of HIV-Associated Lipohypertrophy，主题标签为表观基因组学（Epigenomics），在本站归入内分泌、营养和代谢疾病 / 其他分类。数据集包含 HIV 感染者外周血单核细胞（PBMC）样本的全基因组 DNA 甲基化谱，用于研究 GLP-1 受体激动剂（Semaglutide）对表观遗传衰老的影响及其与临床表型的关系。HIV-1 感染会影响生物学衰老，表观遗传时钟提示 HIV 感染者存在表观遗传年龄加速；尽管有证据表明 GLP-1 受体激动剂对 HIV 相关心脏代谢结局有益，但其对 HIV 表观遗传研究中衰老生物标志物的影响仍是重要的知识空白。该数据集正是为填补这一空白而生成的代表性表观遗传数据资源。

【数据集背景】

HIV-1 感染会加速生物学衰老，表观遗传时钟可在 HIV 感染者中识别出表观遗传年龄加速现象。与此同时，胰高血糖素样肽-1（GLP-1）受体激动剂在 HIV 相关心脏代谢结局方面显示出有益证据，但这类药物对 HIV 感染者衰老生物标志物的影响，在表观遗传研究中尚属显著的知识缺口。该数据集围绕 Semaglutide（一种 GLP-1 受体激动剂）与 HIV 相关脂肪肥厚（lipohypertrophy）的随机试验而生成，旨在通过表观遗传数据考察 GLP-1 受体激动剂对表观遗传衰老的作用及其与临床表型的关系。

【数据内容】

数据集的核心内容是 HIV 感染者外周血单核细胞（PBMC）样本的全基因组 DNA 甲基化谱。样本类型为 PBMC，检测层面为全基因组 DNA 甲基化，数据主题归属表观基因组学。该数据被描述为具有代表性的表观遗传数据集，用于分析 GLP-1 受体激动剂与表观遗传衰老之间的关系，并考察这些表观遗传特征与临床表型之间的关联。关于样本数量、甲基化检测平台、位点覆盖数量、分组设计等具体细节，源站未提供。

【采集与来源】

数据来源于 ncbi.nlm.nih.gov（NCBI）。样本取自 HIV 感染者（people living with HIV）的外周血单核细胞。数据集与一项关于 Semaglutide 在 HIV 相关脂肪肥厚中的随机试验相关联。关于样本采集地点、采集时间、伦理审批信息及具体处理流程，源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于表观遗传衰老研究，特别是 HIV 感染背景下表观遗传年龄加速的考察；可用于研究 GLP-1 受体激动剂（Semaglutide）对 DNA 甲基化谱及表观遗传衰老生物标志物的影响；也可用于探索表观遗传特征与临床表型之间的关系。其主题标签为表观基因组学，适合开展全基因组 DNA 甲基化层面的分析。关于具体可支持的统计模型或分析流程，源站未提供。

【使用方法】

使用时应以 PBMC 来源的全基因组 DNA 甲基化谱为基础，围绕表观遗传衰老与 GLP-1 受体激动剂暴露的关系开展分析，并结合临床表型信息进行关联研究。关于数据下载方式、文件格式、预处理步骤、归一化方法及分析软件建议，源站未提供。

【质量与限制】

该数据集被描述为具有代表性的表观遗传数据集，样本类型为 PBMC，检测内容为全基因组 DNA 甲基化谱。关于数据质量评估指标、缺失值情况、批次效应、样本量及统计效力等信息，源站未提供。使用时应注意到其研究对象为 HIV 感染者，结论外推到其他人群需谨慎；相关限制的详细说明源站未提供。

【引用与许可】

数据集英文名称为 PRJNA1450086: Semaglutide Slows Epigenetic Aging in a Randomized Trial of HIV-Associated Lipohypertrophy，来源站为 ncbi.nlm.nih.gov。关于引用格式、作者列表、发表文献及数据使用许可条款，源站未提供。

原始链接

https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE327270

访问原始数据

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使用方式

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1450086

标准获取流程：

访问源站链接，注册/登录账号；
进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
- ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
- 天池: 登录后页面提供直链下载
  以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

对HIV感染者外周血单核细胞样本进行全基因组DNA甲基化谱分析。HIV-1感染影响生物学衰老，表观遗传时钟突显了HIV感染者表观遗传年龄的加速。尽管有证据表明胰高血糖素样肽-1受体激动剂在改善HIV相关心血管代谢结局方面有益，但其对HIV表观遗传研究中衰老生物标志物的影响仍是一个重大的知识空白。因此，我们构建了一个具有代表性的表观遗传数据集，以探究胰高血糖素样肽-1受体激动剂在表观遗传衰老中的作用及其与临床表型的关系。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别